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質(zhì)粒提取步驟

發(fā)布時(shí)間:2021/7/29 11:25:34      閱讀次數(shù):689

 一、實(shí)驗(yàn)原理:

        堿裂解法提取質(zhì)粒是根據(jù)共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA 與線性染色體DNA 在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們。在pH 值介于12.0 ~12.5 這個(gè)狹窄的范圍內(nèi),線性的DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而被變性,盡管在這樣的條件下,共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA 的氫鍵會(huì)被斷裂,但兩條互補(bǔ)鏈彼此相互盤繞,仍會(huì)緊密地結(jié)合在一起。當(dāng)加入pH 4.8 的乙酸鉀高鹽緩沖液恢復(fù)pH 至中性時(shí),共價(jià)閉合環(huán)狀的質(zhì)粒DNA 的兩條互補(bǔ)鏈仍保持在一起,因此復(fù)性迅速而準(zhǔn)確,而線性的染色體DNA 的兩條互補(bǔ)鏈彼此已完全分開,復(fù)性就不會(huì)那么迅速而準(zhǔn)確,它們纏繞形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),通過離心,染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA ,蛋白質(zhì)-SDS 復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去。
 
二、操作步驟:
        1. 準(zhǔn)備20ml滅菌過的培養(yǎng)管,編號(hào),分別加入8ml LB培養(yǎng)基,再加入8µl 相應(yīng)抗生素,可適量多加;
        2. 用10µl 白色槍頭挑取挑取單個(gè)菌落至培養(yǎng)管中,37℃震蕩過夜(274rpm);
        3. 取2ml過夜培養(yǎng)的菌液加入離心管中,室溫10000rpm離心2min,去上清;(可重復(fù)步驟2,直至菌液離心完)(去上清時(shí)用紙吸一下)
        4. 向留有菌體沉淀的離心管中加入250µl Buffer P1(含RNase A),使用移液槍充分混勻,懸浮菌體菌體;
        5. 向離心管中加入250µl Buffer P2,溫和地上下顛倒混勻4~6次,獲得澄清的裂解液;(劇烈混合會(huì)使剪切染色體DNA,降低質(zhì)粒純度)
        6. 向離心管中加入350µl Buffer N3, 立即溫和地上下顛倒混勻4~6次,此時(shí)出現(xiàn)白色絮狀沉淀。室溫10000rpm離心15min;
        7. 小心將步驟6中所得的上清液轉(zhuǎn)移至潔凈的吸收柱中。要保證沒有吸入沉淀和細(xì)胞碎片。室溫10000rpm離心1min,至裂解物完全通過吸收柱,倒掉收集管中的廢液;
        8. 向吸附柱中加150µl Buffer PB,10000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液;
        9. 向吸附柱中加400µl  Buffer PW(檢查是否加入無水乙醇),10000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液。再空離一次,2min(此時(shí)可以加熱 Buffer EB,65~70℃);
        10. 將吸附柱置于一個(gè)新的離心管中,打開蓋子,吹風(fēng)4min左右(確保乙醇被去除,乙醇會(huì)影響下面的步驟);
        11. 向吸附柱的吸附膜中間部位加90µl Buffer EB(pET系列拷貝數(shù)低,加EB 70μl即可),室溫靜置2min。10000rpm離心1min;
        12. 把液體倒回吸附柱,在10000rpm離心1min;
        13. 混合質(zhì)粒至一個(gè)離心管中,做好標(biāo)記,開蓋室溫放置兩小時(shí)左右。-40℃保存質(zhì)粒。
 
三、注意事項(xiàng):
        1.使用之前,把試劑盒中的一小管RNA酶加入Buffer P1, 4℃保存。
        2.Buffer EB在65~70℃水浴預(yù)熱,可以增加提取效率。


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