由美國(guó) 英國(guó) 中國(guó)等12國(guó)科學(xué)家參加的大洋鉆探旨在打穿地球殼幔邊界.1月16日,美國(guó)微生物學(xué)家在“決心”號(hào)大洋鉆探船上分析微生物樣品.新華社發(fā)

5月22日,在西南印度洋執(zhí)行大洋科考任務(wù)的“向陽紅10”科考船上,科考隊(duì)員順利回收我國(guó)首個(gè)深海沉積物微生物原位培養(yǎng)系統(tǒng).新華社發(fā)

歐洲航天局和俄羅斯聯(lián)邦航天署于3月14日正式啟動(dòng)名為“火星太空生物”的合作項(xiàng)目.當(dāng)日,“質(zhì)子—M”運(yùn)載火箭攜帶該項(xiàng)目軌道飛行器在哈薩克斯坦境內(nèi)發(fā)射升空,軌道飛行器將在火星大氣中尋找可能表明微生物存在的甲烷和其他氣體.新華社發(fā)

在地球生態(tài)系統(tǒng)和人類健康中,微生物組的作用超乎想象,加強(qiáng)基礎(chǔ)研究與應(yīng)用相結(jié)合,推進(jìn)技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)升級(jí),將創(chuàng)造未來新的經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)點(diǎn)

我們認(rèn)知的微生物不到1%

微生物對(duì)我們而言并不陌生.我們的祖先發(fā)明了釀造工藝,就是利用微生物的發(fā)酵功能,讓我們的生活充滿味道和更加豐富多彩.醬香醋滋潤(rùn),酒醇豆腐香,都是微生物作用的結(jié)果.從傳統(tǒng)釀造工藝到現(xiàn)代微生物發(fā)酵技術(shù),我們自以為已經(jīng)對(duì)微生物了解很多,比如我們知道了微生物是如何把糖變成了酒,又轉(zhuǎn)化為醋.我們自以為還能夠掌控微生物,比如我們能夠操控和改造一些微生物產(chǎn)生特殊的代謝產(chǎn)物,提高其產(chǎn)量或者抑制其合成,為人類服務(wù)：例如,包括青霉素在內(nèi)的 拯救了無數(shù)人生命的抗生素,通過改造生產(chǎn)菌種,使產(chǎn)量得到了成千上萬倍的提高,惠及眾生.

但事實(shí)上,我們對(duì)微生物了解很少,我們甚至不知道在我們周圍有什么樣的微生物.從花園里抓一撮土,有幾千種微生物；地球上的微生物細(xì)胞,遠(yuǎn)比天上的星星多得多；我們目前認(rèn)知的微生物,不到1%；生活在我們腸道中的微生物細(xì)胞,是人體細(xì)胞的10倍！這些微生物的基因組之和,是人類基因組的100倍！微生物影響著并超越我們的生老病死：有一天,人死了,微生物卻能永恒生存.除了近年來少量的有關(guān)糖尿病等與腸道微生物的關(guān)系外,我們完全不清楚腸道微生物（還有呼吸道微生物 體表微生物等）在人體內(nèi)做了什么,它們的喜怒哀愁與我們的生老病死是什么關(guān)系.

微生物組是指一個(gè)生態(tài)系統(tǒng)中全部微生物資源及生命信息,包括他們與其環(huán)境中生物和非生物因子之間的關(guān)系.早在1975年,科學(xué)家就用類似的概念來探討白蟻腸道的微生物區(qū)系,但由于受當(dāng)時(shí)的研究技術(shù)手段和對(duì)微生物認(rèn)知的限制,沒有形成重大的科學(xué)計(jì)劃.2005年以來,世界許多國(guó)家先后不同程度上啟動(dòng)了微生物組計(jì)劃或項(xiàng)目,如美國(guó)的人體微生物組計(jì)劃和地球微生物組計(jì)劃,加拿大的微生物組研究項(xiàng)目以及日本的人體元基因組研究項(xiàng)目等.2015年10月,美國(guó)一批科學(xué)家聯(lián)合在《科學(xué)》雜志上發(fā)文,呼吁“聯(lián)合微生物組研究計(jì)劃”；與此同時(shí),我國(guó)科學(xué)家會(huì)同美 德科學(xué)家,在《自然》上發(fā)文提出了實(shí)施“國(guó)際微生物組計(jì)劃”的呼吁.美國(guó)日前宣布啟動(dòng)新的“國(guó)家微生物組計(jì)劃”,引發(fā)了新一輪微生物研究和開發(fā)的熱潮.

微生物組世界1+1>2

為什么微生物組能夠引起國(guó)際上如此巨大反響和關(guān)注？1928年7月,科學(xué)家亞歷山大—弗萊明正在凝視培養(yǎng)皿里的微生物菌落：一種菌落（青霉菌）抑制了另一種菌落（金黃色葡萄球菌）的生長(zhǎng),從此揭開了發(fā)現(xiàn)微生物合成抗生素的偉大時(shí)代.青霉素的發(fā)現(xiàn),改變了第二次世界大戰(zhàn)的進(jìn)程,挽救了無數(shù)人的生命,并顯著提高了人類普遍的壽命.一種微生物拯救了成千上萬的個(gè)體生命,一群微生物能夠拯救未來人類的生存.

地球上的微生物物種粗略估計(jì)在百萬數(shù)量級(jí)之上,目前發(fā)現(xiàn)和描述的只有數(shù)萬種,絕大多數(shù)微生物物種及其功能還有待挖掘和認(rèn)知.微生物生活在海洋和陸地的每一寸空間,組成海洋微生物組和陸地微生物組,參與物質(zhì)元素的生物地球化學(xué)循環(huán),影響全球氣候變化；微生物與農(nóng)作物（根際 葉表 植物體內(nèi)）在一起,構(gòu)成農(nóng)作物微生物組,影響作物營(yíng)養(yǎng)吸收 病害發(fā)生和作物產(chǎn)量；微生物降解污染物,消除黑臭,保障污水處理廠高效運(yùn)行,凈化水體；微生物還是污染土壤生物修復(fù)的主力軍,農(nóng)藥 化工污染物 除草劑等主要是通過微生物降解作用得到消除,環(huán)境微生物組將為實(shí)施生態(tài)文明建設(shè) 提高環(huán)境質(zhì)量的國(guó)家目標(biāo),提供資源和技術(shù)的保障.

微生物組在地球生態(tài)系統(tǒng)和人類健康中的作用超乎想象,它不僅將極大地幫助人類克服當(dāng)今所面臨的生存挑戰(zhàn),還能提供人類未來生存之道,這其中有一個(gè)道理,就是微生物之間能夠互相協(xié)作,使得它們?cè)谏鷳B(tài)系統(tǒng)中更加穩(wěn)定 更加有效發(fā)揮作用,并賦予微生物組（群）具有超越單個(gè)微生物的更為強(qiáng)大的功能.多環(huán)芳香烴是環(huán)境中重要的一類污染物,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了能夠降解多環(huán)芳香烴類化合物的微生物,一種微生物單獨(dú)培養(yǎng),可以降解多環(huán)芳香烴,但如果多個(gè)微生物在一起,其污染物的降解效率和微生物系統(tǒng)的穩(wěn)定和適應(yīng)能力都大大提高.

我國(guó)傳統(tǒng)發(fā)酵工藝多利用混合微生物菌群,例如年產(chǎn)值超過5000多億元的制酒行業(yè),在長(zhǎng)達(dá)數(shù)百年的歷史過程中有益微生物群被不斷富集,逐漸形成各種風(fēng)格的白酒釀造技藝.盡管科學(xué)上還沒有準(zhǔn)確的解釋,但業(yè)界共識(shí)是,不同微生物群落之間的相互作用是產(chǎn)生不同風(fēng)格白酒的重要基礎(chǔ),釀酒微生物場(chǎng)所提供了多種多樣的微生物資源,可以從中發(fā)掘高效纖維素降解霉菌 高乙醇合成酵母 高效一碳化合物固定細(xì)菌等.作為新興產(chǎn)業(yè)的生物農(nóng)藥和生物肥料,近年來正在蓬勃發(fā)展,從生物農(nóng)藥近10年國(guó)際上的發(fā)展情況來看,市場(chǎng)份額由2000年0.2%增長(zhǎng)到2009年的3.7%,2010年全球生物農(nóng)藥的產(chǎn)值超過20億美元,市場(chǎng)占有率達(dá)到4%左右.深入解剖土壤和農(nóng)作物微生物組,可以有效促進(jìn)傳統(tǒng)發(fā)酵行業(yè)和新興生物產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展.

抓住彎道超車的機(jī)遇

截至2016年,有資料可查的國(guó)際上微生物組研究項(xiàng)目有13項(xiàng)與人類健康相關(guān),其中8項(xiàng)正在實(shí)施,5項(xiàng)已經(jīng)完成.美國(guó) 加拿大 愛爾蘭和法國(guó)是這些項(xiàng)目的主要參與國(guó)家,其中至少有2項(xiàng)由美國(guó)獨(dú)立開展,最早的一項(xiàng)人類微生物組計(jì)劃（HMP）也是美國(guó)開展的.中國(guó)積極參與了人類腸道宏基因組計(jì)劃（MetaHIT）和國(guó)際微生物組聯(lián)盟（IHMC）計(jì)劃這兩項(xiàng)計(jì)劃.

除了上述13個(gè)與人類健康直接相關(guān)的人體微生物組研究項(xiàng)目之外,國(guó)際上還啟動(dòng)了9個(gè)環(huán)境微生物組研究計(jì)劃.這些環(huán)境微生物組研究計(jì)劃中包括海洋微生物組 土壤微生物組和地球微生物組（EMP）.其中EMP計(jì)劃旨在全方位分析地球上全部微生物群落的多樣性及功能,該項(xiàng)目將對(duì)全球典型的環(huán)境樣本包括土壤 海洋 空氣 淡水生態(tài)系統(tǒng)等的微生物群落進(jìn)行宏基因組測(cè)序,中國(guó)參與了EMP計(jì)劃.中國(guó)科學(xué)家和有關(guān)機(jī)構(gòu)曾獨(dú)立推進(jìn)和啟動(dòng)了與微生物組內(nèi)容相關(guān)的研究計(jì)劃.早在本世紀(jì)初,中國(guó)科學(xué)院微生物所有關(guān)專家就開始推動(dòng)“微生物地球”研究計(jì)劃；2014年,中國(guó)科學(xué)院組織并啟動(dòng)了土壤微生物相關(guān)的先導(dǎo)專項(xiàng)研究計(jì)劃,目前,國(guó)家自然科學(xué)基金委“水圈微生物”研究計(jì)劃正在論證之中.中國(guó)科學(xué)家已經(jīng)在人體微生物組和釀造微生物組等方面,取得了很好的成績(jī).抓住機(jī)遇,做好組織,在未來新一輪微生物科技發(fā)展中,中國(guó)完全有可能發(fā)揮國(guó)際主導(dǎo)作用.

從微生物組的提出和國(guó)際科技競(jìng)爭(zhēng)態(tài)勢(shì)看,微生物組研究呈現(xiàn)四大趨勢(shì)：應(yīng)用導(dǎo)向更加明確,范圍更加廣泛,由先前的微生物資源調(diào)查和側(cè)重人體微生物組正在向綜合考慮健康 農(nóng)業(yè) 生態(tài)環(huán)境等方向轉(zhuǎn)變；更加注重技術(shù)發(fā)展和學(xué)科交叉匯聚；更加需要項(xiàng)目組織機(jī)制的創(chuàng)新；對(duì)大科學(xué)計(jì)劃和全球化合作的重要性更加明顯,為世界各國(guó)從科技和政治角度參與國(guó)際事務(wù)并發(fā)揮各自獨(dú)特作用,提供了一個(gè)無限的舞臺(tái).

在當(dāng)前的國(guó)際形勢(shì)和國(guó)家需求下,啟動(dòng)我國(guó)獨(dú)立自主的微生物組研究計(jì)劃已經(jīng)勢(shì)在必行.如何立足我國(guó)的國(guó)情和研究基礎(chǔ),實(shí)現(xiàn)基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究有機(jī)結(jié)合,服務(wù)技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)升級(jí)聯(lián)動(dòng)發(fā)展,是我國(guó)進(jìn)行微生物組計(jì)劃組織和布局的重要選擇依據(jù).基于此,對(duì)發(fā)展我國(guó)微生物組有以下三點(diǎn)建議：

一 以我國(guó)在微生物資源的收集和保藏的優(yōu)勢(shì) 在研究和開發(fā)方面的良好基礎(chǔ),組織全國(guó)專家,進(jìn)行戰(zhàn)略研究,規(guī)劃微生物組研發(fā)路線圖,明確從微生物組研究入手,解決我國(guó)面臨的人類健康 環(huán)境保護(hù)和農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展等重大挑戰(zhàn)的技術(shù)途徑,開展以應(yīng)用為導(dǎo)向的微生物組資源和技術(shù)開發(fā).

二 以人體腸道 四大口糧作物 污染水體和土壤治理 傳統(tǒng)發(fā)酵等為核心對(duì)象,快速部署人體微生物組 農(nóng)作物微生物組 環(huán)境微生物組和傳統(tǒng)發(fā)酵微生物組的研究,加強(qiáng)基礎(chǔ)和應(yīng)用基礎(chǔ)研究 技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)發(fā)展的全鏈條布局；依靠我國(guó)在微生物資源的研究 測(cè)序技術(shù) 微生物數(shù)據(jù)綜合分析能力等方面的優(yōu)勢(shì),啟動(dòng)涵蓋人體 農(nóng)業(yè) 環(huán)境 傳統(tǒng)發(fā)酵 新技術(shù)等內(nèi)容的“中國(guó)微生物組”計(jì)劃.

三 建立國(guó)家微生物組數(shù)據(jù)中心,實(shí)現(xiàn)大數(shù)據(jù)集成與應(yīng)用：數(shù)據(jù)資源是微生物組研究的關(guān)鍵,建議在微生物組計(jì)劃設(shè)計(jì)之初,就設(shè)計(jì)好完善的數(shù)據(jù)集成和共享機(jī)制,建立國(guó)家微生物組數(shù)據(jù)中心,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)資源的有效集成和深度挖掘.

微生物在地球上無處不在,從滾燙的熱泉到800米冰層以下的南極暗湖,都存在著大量的微生物.微生物作為地球上分布最為廣泛 生物量最大 生物多樣性最為豐富的生命形式,推動(dòng)地球化學(xué)物質(zhì)循環(huán),影響人類健康乃至地球的整個(gè)生態(tài)系統(tǒng),且蘊(yùn)藏著極為豐富的物種資源和基因資源.我們期待著微生物組能夠打開未知微生物世界的大門,為應(yīng)對(duì)當(dāng)今人類面臨的巨大挑戰(zhàn),如人類健康 環(huán)境保護(hù) 農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展等,以及解決深空探索和外星移民等未來人類生存空間問題,提供重要的解決方案.