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新城疫病毒實時熒光定量PCR試劑盒

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通用名稱:新城疫病毒檢測試劑盒(實時熒光PCR法)

英文名稱Newcastle disease virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)

【包裝規(guī)格】25T/& 50T/

【預期用途】

本試劑盒適用于新城疫病毒檢測,可用于臨床新城疫病毒感染的輔助診斷,但不作確診使用。

【檢驗原理】

本試劑盒針對新城疫病毒基因組高度保守區(qū)域設(shè)計特異性引物和探針,在反應體系中含新城疫病毒基因組模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應通道信號進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結(jié)果的定性分析。

【主要組成成份】

序號

組成

25T/

50T/

1

ND病毒RT-PCR反應液

375 μL×1

750 μL×1

2

ND病毒逆轉(zhuǎn)錄酶

 50 μL×1

100 μL×1

3

ND病毒Taq

 75 μL×1

150 μL×1

4

ND病毒陽性對照

 40 μL×1

 40 μL×1

5

ND病毒陰性對照

 40 μL×1

 40 μL×1

6

說明書

1

1

注:陰性對照為雞基因組DNA,陽性對照為失去活性的新城疫病毒cDNA。

【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。

【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。

【樣本要求】

1.活禽樣品取咽喉拭子和泄殖腔拭子,采集方法如下:

(1) 咽喉拭子,采取時要將拭子深入喉頭及上愕裂來回刮3次~5次,取咽喉分泌液;

(2) 泄殖腔拭子,將拭子深入泄殖腔轉(zhuǎn)一圈沾取糞便;

(3) 將咽喉拭子和泄殖腔拭子一起放入盛有 1.0 mL 生理鹽水的離心管中備用。

2.血液或血清樣品:使用無菌注射液抽取樣品置于離心管中待檢。

3.肌肉或內(nèi)臟樣品:取少量樣品(23克)于研缽或勻漿器中研磨,然后將研磨勻漿轉(zhuǎn)入無菌離心管中,3000rpm/min 離心10分鐘取上清待檢。

4.應避免標本間交叉污染。

5.標本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于28冷藏過夜保存;如需長期保存,標本應凍存于-80以下,避免反復凍融。

【檢驗方法】

1. 試劑準備(試劑準備區(qū))

1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。

2)核算當次實驗所需要的反應數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。

n =陰性對照數(shù)(1T+陽性對照數(shù)(1T+誤差預留量(1T+樣本數(shù)

單反液配制表(每份)

RT-PCR反應液

15.0 μL

逆轉(zhuǎn)錄酶

 2.0 μL

Taq

 3.0 μL

 (3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。

2.樣本準備(樣本處理區(qū))

QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。

3.加樣

 在上述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。

4. PCRPCR擴增區(qū))

1)取樣本處理區(qū)準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。

2)按下表設(shè)置儀器核酸擴增相關(guān)參數(shù)進行PCR擴增。


反應體積

25 μL

通道選擇

FAM通道采集新城疫病毒熒光信號

PCR

反應

條件

步驟

條件

循環(huán)數(shù)

反轉(zhuǎn)錄

    42℃10分鐘(min

1

預變性

95℃3分鐘(min

1

預擴增

95℃5秒(s

5

55℃40秒(s

PCR擴增

95℃5秒(s

40

55℃40秒(s

(此階段結(jié)束時采集熒光信號)

 

注:ABI系列熒光PCR儀在設(shè)置時不選ROX校正,設(shè)置淬滅基團選擇None。

【參考值(參考范圍)】

1.試劑盒有效性判定:

1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct≤35

2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。

2.標本結(jié)果判定:

1陽性:標本檢測結(jié)果Ct≤35或有明顯指數(shù)增長期。

2)可疑:標本檢測結(jié)果Ct值在3538范圍內(nèi)。此時應對標本進行重復檢測,如重復實驗結(jié)果Ct值仍在3538范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。

3)陰性:標本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。

【檢驗結(jié)果的解釋】

通道及檢測結(jié)果

標本檢測結(jié)果解釋

FAM

+

標本中檢出新城疫病毒RNA

-

標本中未檢出新城疫病毒RNA

【檢驗方法的局限性】

1. 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的最低檢出限時可能會發(fā)生假陰性的結(jié)果。

2. 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結(jié)果。

3. 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結(jié)果。

【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的最低檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV≤5%。

【注意事項】

1. 整個檢測過程應嚴格按照本說明書要求分別在試劑準備區(qū)、樣本處理區(qū)和PCR擴增區(qū)進行操作,各區(qū)實驗服、儀器、耗材應獨立使用,不能混用;實驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區(qū)應配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進行操作;三個區(qū)應該配有紫外線殺菌裝置。

2. 為避免RNA降解,樣本處理過程應在0-4℃條件下操作,且完成實驗后立即上機檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應經(jīng)過無核酶處理。

3. 每次實驗應該設(shè)置陰、陽性對照。

4. 試劑盒所有試劑在使用前應該在常溫下充分融化混勻,并應瞬時離心。

5. 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在第一次使用前應全部轉(zhuǎn)移至標本準備區(qū),并單獨存放。

6. 為防止熒光干擾,應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免在PCR反應管上進行任何標記。

7. 儀器擴增相關(guān)參數(shù)應按照本說明書相關(guān)要求進行設(shè)置;不同批號試劑不能混用。

8. ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設(shè)置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None。

9. 實驗過程中產(chǎn)品的廢棄物應該進行無害化處理后方可丟棄。

 

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