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絲狀真菌線粒體 DNAout

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產(chǎn)品及特點(diǎn)

線粒體是重要的、負(fù)責(zé)能量產(chǎn)生的極其重要的細(xì)胞器。對(duì)絲狀真菌線粒體進(jìn)行生化,遺傳和分子生物學(xué)研究都需要先進(jìn)行線粒體純化。本產(chǎn)品就是基于密度梯度離心的,專(zhuān)門(mén)用于從絲狀真菌葉片中純化完整線粒體、再?gòu)闹屑兓粒體 DNA 的試劑盒。它具有下列特點(diǎn):

1. 即用型試劑盒,用戶(hù)不需要單獨(dú)配制各種溶液。

2. 所得線粒體可用于后續(xù)的 SDS-PAGE、Western、ELSIA、蛋白組分析、線粒DNA 和線粒體 RNA 純化。

3. 本產(chǎn)品足夠 15 次線粒體純化和 15 次線粒體 DNA 提取,每次可處理 10-20g 菌絲體,能得到 1-5 mg 左右線粒體。

4. 已經(jīng)成功用于 Aspergillus candidus、Aspergillus nidulans、Magnaporthe oryzae 、 Neurospora  crassa 、 Penicillium chrysogenum 、 Rhizopus

stononifer 等絲狀真菌。

規(guī)格及成分

 

號(hào)

15 次大盒包裝

 

絲狀真菌線粒體 DNAout

溶液 A

130831a

250 mL×2

絲狀真菌線粒體 DNAout

成分 B

130831b

150 g(干粉)

絲狀真菌線粒體 DNAout

溶液 C

130831c

120 mL

帶柄尼龍濾膜

130831d

1 個(gè)

通用線粒體 DNAout 溶液 A

130831e

10 mL

通用線粒體 DNAout 溶液 B

130831f

5 mL

使用手冊(cè)

130831sc

1 份

運(yùn)輸及保存

常溫運(yùn)輸和保存, 保存期限一年。

自備試劑

去離子水、氯仿、異丙醇、75%乙醇、TE

使用方法

注意:純化  DNA  提取用的線粒體的要求比純化功能研究用的線粒體的要求要低,但整個(gè)操作還是最好在冰上或者在冷室進(jìn)行,所用器皿和溶液最好在   4℃預(yù)冷,離心最好要在 4℃進(jìn)行,離心力以 g 而不是 rpm 計(jì)算。

一:菌絲的搖瓶培養(yǎng)

1. 使用合適的絲狀真菌培養(yǎng)基,接種孢子至終濃度為 2×10E6/mL。一般 100 mL 液體培養(yǎng)基可以得到 0.8-1.2g 菌絲體,而本方法一次可以處理 10-20g 菌絲體, 故最好一次培養(yǎng) 1-2 L。

2. 在合適的溫度(25℃、30℃或 37℃,根據(jù)真菌不同而不同)250rpm/min


 

搖晃培養(yǎng) 16-20 小時(shí)。

3. 用多層紗布或多層過(guò)濾紙過(guò)濾收集菌絲,用冰浴的自備去離子水洗滌菌絲三次去  除殘留的培養(yǎng)基。

4. 用吸水紙吸干菌絲的水分,稱(chēng)重后立即使用。如果在-80℃或液氮長(zhǎng)期放置,線  粒體回收效率將減低。

二:線粒體粗提液的制備

5. 制備絲狀真菌線粒體 DNAout 溶液 A 工作液:每次提取需 150mL 溶液 A 工作液,制備方法是將 20mL溶液 A 和 130mL 自備去離子水混合,冰上預(yù)冷即可。

6. 200mL 燒杯中,加入 100mL 預(yù)冷的溶液 A 工作液,再加入新制備的菌絲體, 然后全部轉(zhuǎn)移到 Waring 勻漿機(jī)(家用果汁勻漿機(jī))中,低速勻漿 10 秒,避免起泡沫。用玻璃棒把菌絲按入勻漿機(jī)底部后,再低速勻漿 10 秒。注意:還可以選擇 Dounce 玻璃勻漿器,Polytron 勻漿機(jī)和研磨(加玻璃珠)等方法,但它們單次處理量一般都較小,需多份處理再匯集。

7. 用帶柄尼龍濾膜過(guò)濾勻漿液,用預(yù)冷的 200 mL 量筒收集穿透液。

8. 將剩下的菌絲體轉(zhuǎn)移到 Waring 勻漿機(jī)中,再加入 40 mL 預(yù)冷的溶液 A 工作液, 低速勻漿 10 秒,用上步的帶柄尼龍濾膜過(guò)濾,用預(yù)冷的 200 mL 量筒收集穿透液。注意:帶柄尼龍濾膜后可反復(fù)使用。

9. 將穿透液分到 4 個(gè)預(yù)冷的 50 mL 的塑料離心管中(每個(gè)約 35 mL

10. 在水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)上 44000 g 離心 10 分鐘,小心轉(zhuǎn)移上清(含線粒體的部4  個(gè)新的離心管中。沉淀含細(xì)胞核和未裂解的細(xì)胞,可以棄之不用。如果要用于純化細(xì)胞核 DNA,則可以放-80℃長(zhǎng)期保留。

11. 將含上清液的 4 個(gè)離心管在 4℃ 10000 g 離心 20 分鐘。

12. 每個(gè)離心管中加 2.5mL 預(yù)冷的溶液 A 工作液重懸線粒體沉淀并匯集共約 10 mL,此為線粒體粗提液。

13. 如果直接用線粒體粗提液提取線粒體 DNA,容易有細(xì)胞核 DNA 污染。具體步驟是:在水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)上 410000 g 離心 7 分鐘,小心棄上清,沉淀為線粒體,直接用于第三步的線粒體 DNA 提取。

14. 如果需要高純度、無(wú)污染的線粒體 DNA,則需要用密度梯度離心法將完整的線粒體和其他細(xì)胞碎片進(jìn)一步分離。具體見(jiàn)下步線粒體精提液的制備。

三:線粒體精提液的制備(密度梯度離心法)

15. 制備重液和輕液:將 4.1 克成分 B 干粉加到 6.3 mL 溶液 C 中,充分搖晃混勻


 

10 mL 重液。將 4.1 克成分 B 干粉加到 6.3 mL 去離子水中,充分搖晃混勻

10mL 輕液。

16. 50 mL 塑料離心管中先加入 10 mL 重液,再在其上輕輕加上 10 mL 輕液, 最后加上第 11 步所得的約 10 mL 線粒體粗提液。

17. 加平衡離心管后在水平轉(zhuǎn)子冷凍超速離心機(jī)上 443000 g離心 2 小時(shí),重液和輕液間的帶為完整線粒體。

18. 用廣口吸管小心將線粒體移到新的離心管中,加入等倍體積的預(yù)冷的絲狀真菌線  粒體 DNAout 溶液 C,輕柔混勻。取少量在相差顯微鏡下檢查線粒體完整性。

19. 在水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)上 419000 g 離心 20 分鐘,小心將上清吸出后,線粒體沉淀可以直接用于 DNA 提取。

四:線粒體 DNA 提取

20.  600 μL 通用線粒體 DNAout 溶液 A 加入到上步得到的線粒體沉淀中并吹打混勻,然后轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 離心管中。

21. 65℃放置 5 分鐘。

22. 加入 300 μL 通用線粒體 DNAout 溶液 B,震蕩混勻 10-30 秒。注意:溶液 B非常粘稠,可以將其預(yù)熱到 65℃并剪掉一截槍頭后再取。

23. 加入 200 μL 自備的氯仿,震蕩混勻 10-30 秒。

24. 12,000 g 室溫離心 3 分鐘。此時(shí)上清液將變得透明,中間層有白膜。

25. 小心轉(zhuǎn)移上清液(0.8 mL)到一個(gè)新的 1.5 mL 離心管中,避免觸及中間層的白膜,可留少量上清不取。

26. 加入 1 倍體積的自備異丙醇,顛倒 30 次混勻。

27. 12,000 g 室溫離心 5 分鐘,小心棄上清液。

28. 在離心管中加入 1 mL 自備的 75%乙醇,震蕩 30 秒。

29. 12,000 g 室溫離心 1 分鐘,小心棄上清液。

30. 12,000 g 室溫離心半分鐘,殘留液體將匯集在管底。

31. 用洗液槍吸棄管底殘留液(約 50 μL)。

32.  50-100 μL 自備的 TE 緩沖液,溶解 DNA 沉淀即得線粒體 DNA 溶液。直接 5-10 μL 電泳檢測(cè),其余放直接使用或放-80℃冰箱備用。

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

 

柱式絲狀真菌線粒體純化試劑盒

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