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RNAeasy™動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)

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 離心柱式RNAeasy™動物RNA抽提試劑盒(RNAeasy™ Animal RNA Isolation Kit with Spin Column)是一種基于離心柱法從動物組織或培養(yǎng)的動物細(xì)胞中安全、快速、便捷、穩(wěn)定、高效、高質(zhì)量地抽提長度大于200個核苷酸(nucleotide, nt)的RNA的試劑盒。抽提獲得的大于200個核苷酸的RNA(也常被稱為總RNA)可以用于各種常規(guī)用途。

 

 

 

 

 

本試劑盒抽提得到的RNA可用于反轉(zhuǎn)錄、RT-PCR、qPCR、Northern、點雜交(Dot Blot)、純化mRNA、體外翻譯、RNase protection assay、cDNA克隆等下游實驗;也可用于基因表達(dá)芯片分析(microarray)、高通量測序(high throughput
sequencing)等對RNA質(zhì)量要求較高的情況。
三款離心柱式及Trizol法RNA抽提試劑盒的主要特點和差異如下:

產(chǎn)品編號 R0024/ R0026/ R0027 R0028 R0032 R0011/R0016
產(chǎn)品名稱 RNAeasy™動物RNA
抽提試劑盒
RNAeasy™動物小RNA
抽提試劑盒
RNAeasy™ Plus動物RNA
抽提試劑盒
Beyozol Trizol
推薦指數(shù) ★★★★★ ★★★★★ ★★★ ★★
抽提方式 離心柱式 離心柱式 離心柱式 原始方式
抽提產(chǎn)物 RNA(>200nt) 小RNA(<200nt) 總RNA(含<200nt的小RNA) 總RNA(含<200nt的小RNA)
操作時間 最短(15-20分鐘) 稍較長(20-25分鐘) 較長(25-30分鐘) 最長(45-60分鐘)
操作步驟 4步驟() 6步驟() 6步驟() 很多步驟
使用便捷性 ★★★★★ ★★★★ ★★★★ ★★
推薦細(xì)胞量/得率 50-100萬/5-20μg 50萬/1-2μg 50-100萬/5-20μg 50-100萬/5-20μg
推薦組織量/得率 5-20mg/10-40μg () 5mg/1-1.5μg () 3-5mg/3-10μg () 50mg/100-500μg (很多)
RNA純度
有毒有害試劑
人體與環(huán)境安全
國外同類產(chǎn)品 RNeasy Mini Kit (Qiagen)
PureLink® RNA Mini Kit
(Thermo)
PureLink® miRNA Isolation Kit (Thermo) miRNeasy Mini Kit (Qiagen) TRIzol (Thermo)
用途 非小RNA相關(guān)各種用途 小RNA相關(guān)各種用途 不同長度RNA各種用途 不同長度RNA各種用途

動物組織或細(xì)胞中的RNA按照長度可以分為長鏈RNA(long RNA)和小RNA(small RNA),長鏈RNA通常大于200nt,而小RNA通常小于200nt。長鏈RNA按照是否編碼蛋白或多肽可以分為長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)和mRNA。小RNA主要包括非編碼的5.8S rRNA(ribosomal RNA)、5S rRNA、tRNA(transfer RNA)、microRNA(miRNA)、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(Piwi-associated small RNA)、tsRNA(tRNA-derived small RNA)、srRNA(small rDNA-derived RNA)等。
本試劑盒抽提RNA的基本流程如圖1所示。樣品在裂解液中迅速裂解,釋放出總RNA,然后讓RNA特異性地結(jié)合到純化柱上,而基因組DNA和蛋白質(zhì)等其它組分通過高速離心被有效去除,再通過3次洗滌充分去除非特異性結(jié)合的蛋白、鹽等雜質(zhì),最后用洗脫液將高純度的RNA洗脫下來。

圖1. 離心柱式RNA抽提流程示意圖

本試劑盒使用安全。本試劑盒通過特殊的柱純化介質(zhì)進(jìn)行RNA分離純化,能有效避免傳統(tǒng)的Trizol法抽提時使用的酚、氯仿等有毒有害有機(jī)試劑。
本試劑盒使用快速、便捷。本試劑盒采用柱純化,無需繁瑣的RNA沉淀步驟,抽提操作過程僅15-20分鐘。相比于傳統(tǒng)的Trizol抽提法,本試劑盒的操作流程顯著簡化,縮短了抽提時間,降低了RNA被降解的風(fēng)險。和國外同類柱純化產(chǎn)品相比,所需操作步驟和操作時間基本一致。
本試劑盒抽提RNA的得率高,優(yōu)于國外同類產(chǎn)品。本試劑盒的抽提效果經(jīng)反復(fù)測試,100萬個HeLa細(xì)胞能抽提得到約15-20μgRNA,20mg小鼠肝組織能抽提得到約25-35μgRNA,20mg小鼠腦組織中抽提得到約10-20μgRNA(新鮮樣品的得率高于凍存樣品)。本試劑盒與傳統(tǒng)的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產(chǎn)品的抽提效果對比參見圖2。
本試劑盒抽提得到的RNA純度高,顯著優(yōu)于Trizol和國外Q品牌的同類產(chǎn)品。本試劑盒抽提得到的RNA的A260/A280通常為2.0-2.2。A260/A230通常為1.9-2.1。本試劑盒與傳統(tǒng)的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產(chǎn)品的抽提效果對比參見圖2。由圖2可知,本試劑盒在抽提組織樣品的RNA時,A260/A230非常顯著地高于Trizol法和Q品牌的同類產(chǎn)品,提示純度高。

圖2. 本試劑盒與Trizol、Q品牌同類產(chǎn)品的RNA抽提效果對比。樣品為凍存的50萬個HeLa細(xì)胞、20mg小鼠肝組織和20mg小鼠腦組織。洗脫液用量均為40μl。均取6μl洗脫的樣品經(jīng)變性處理后,在含6.67%甲醛和適量NA-Red的1.2%變性瓊脂糖凝膠中電泳約45分鐘后拍照。實際抽提效果會因?qū)嶒灄l件、檢測儀器等的不同而存在差異,本圖僅供參考。
注:純的RNA其A260/A280約為2.0,但在很多儀器上測定時會高于2.0,低于1.9通常認(rèn)為有蛋白、DNA或者酚等的污染;純的RNA其A260/A230約為2.0左右或者略高,低于1.9通常認(rèn)為有碳水化合物、胍鹽、多肽或酚等的污染。

本產(chǎn)品與Qiagen公司的RNeasy Mini Kit一致,用于純化200nt以上的RNA,對小于200nt的small RNA即小RNA(如5.8S rRNA、5S rRNA、tRNA、miRNA、piRNA等)被選擇性地去除,如果希望抽提得到小于200nt的小RNA,推薦RNAeasy™動物小RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0028)或RNAeasy™ Plus動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0032)。
本試劑盒適用于新鮮或凍存的動物組織或細(xì)胞RNA的抽提,推薦的細(xì)胞用量為50-100萬(上限可達(dá)1000萬),組織用量為15-20mg(上限可達(dá)30mg)。對于不同的組織或細(xì)胞上限會有所差別,例如小鼠肝臟組織的上限可達(dá)30mg,但肌肉組織的上限為20mg。
本試劑盒可用于12個樣品的RNA抽提。
包裝清單:

產(chǎn)品編號 產(chǎn)品名稱 包裝
R0024-1 裂解液 8ml
R0024-2 結(jié)合液 8ml
R0024-3 洗滌液I 8ml
R0024-4 洗滌液II 15ml
R0024-5 洗脫液 1.2ml
R0024-6 RNA純化柱及廢液收集管 12套
R0024-7 RNA洗脫管 12個
說明書 1份

保存條件:
室溫保存,一年有效。
注意事項:
對于富含RNase的樣品(如動物組織),建議使用前在裂解液中添加二硫蘇糖醇(Dithiothreitol, DTT)至終濃度為40mM (例如1ml裂解液中加入20μl 2M DTT)或β-巰基乙醇至終濃度為1% (如1ml裂解液中加入10μl β-巰基乙醇)。含DTT或β-巰基乙醇的裂解液可在室溫放置1個月。
通過本試劑盒抽提到的RNA已經(jīng)去除絕大多數(shù)DNA,通常情況無需DNase處理。后續(xù)如進(jìn)行某些對極少量DNA殘留較敏感的實驗時,可以在使用說明中步驟4離心后,在純化柱中加入適量DNase I (如80μl含10U DNase I的酶溶液,推薦使用DNase I,D7076),室溫消化15分鐘。消化結(jié)束后,不要離心,直接加入500μl洗滌液II,進(jìn)入使用說明的步驟5進(jìn)行操作。
本試劑盒提供的所有試劑和耗材都是RNase-free,操作時應(yīng)小心,避免被污染。所有自行準(zhǔn)備的試劑和耗材也都應(yīng)是RNase-free。如果可能有RNase污染,可考慮用0.01%的DEPC水浸泡過夜,然后高溫高壓滅菌并烘干。操作時應(yīng)避免對著樣品或所使用的試劑盒耗材呼氣或說話,以防RNase污染。建議戴一次性口罩操作。
對于操作環(huán)境中RNA酶的去除,推薦使用生產(chǎn)的RNase and DNase Away (R0123)以去除實驗桌面上或其它接觸面上的RNase。
使用凍存的細(xì)胞或組織抽提RNA的效果通常比新鮮的細(xì)胞或組織差一些。因為在細(xì)胞或組織凍融過程中一些細(xì)胞或組織內(nèi)的RNase會被釋放出來并剪切樣品中的RNA。對于組織樣品,推薦使用RNALater™動物組織RNA穩(wěn)定保存液(R0118)進(jìn)行保存以保證樣品RNA的完整性。
本試劑盒所有操作均在室溫進(jìn)行,操作時無需冰浴。所有離心也均在室溫進(jìn)行。
廢液收集管在一次抽提中需多次使用,切勿中途丟棄。
結(jié)合液、洗滌液中含有乙醇,使用后須旋緊瓶蓋以防揮發(fā),并須按照易燃試劑的相關(guān)規(guī)范進(jìn)行存放和使用。
本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

 

 

 

 

 


使用說明:
1. 樣品的準(zhǔn)備。
細(xì)胞樣品:收集50-100萬左右的細(xì)胞。對于懸浮細(xì)胞,1000-2000g離心1分鐘后棄上清,加入300μl裂解液,輕輕吹打8-10次至固懸物溶解、溶液澄清;對于貼壁細(xì)胞,吸凈培養(yǎng)液后加入300μl裂解液,輕輕吹打5-10次至固懸物溶解、溶液澄清,轉(zhuǎn)移至一潔凈離心管內(nèi)。
組織樣品:取15-20mg動物組織,置于液氮中研磨成粉末,立即加入600μl裂解液。也可將組織置于1.5ml離心管中,迅速加入600μl冰浴預(yù)冷的裂解液,用微型電動勻漿器勻漿,或者用普通玻璃勻漿器進(jìn)行勻漿。研磨或勻漿后,輕輕吹打勻漿液8-10次,室溫放置3-5分鐘。然后約14,000g離心2分鐘,將上清液移至新的離心管中。對于比較容易裂解且勻漿很充分的組織(如肝組織、腦組織等)可以不用高速離心而直接進(jìn)入步驟2。
注意:細(xì)胞的數(shù)量一般不超過500萬,不超過100萬細(xì)胞宜使用300μl裂解液,多于100萬細(xì)胞宜使用600μl裂解液。動物組織的用量一般不超過30mg,用量過多可能會因裂解不充分導(dǎo)致得率下降。組織樣品在裂解和離心后,離心管下部可能會有一些膠狀物質(zhì),宜作為上清轉(zhuǎn)移至下一步操作。如果棄除膠狀物,會導(dǎo)致得率下降約30-50%。后續(xù)加入結(jié)合液后膠狀物會消失。離心是為了去除未勻漿充分的明顯塊狀物。如果裂解后仍有粘稠物,需增加吹打次數(shù)至溶液完全澄清。對于富含RNase的樣品,裂解液中宜添加DTT至終濃度為40mM或添加β-巰基乙醇至終濃度為1%。
2. 加入等體積結(jié)合液至裂解液中,輕輕顛倒混勻3-5次。此時可能會有沉淀物產(chǎn)生,屬于正,F(xiàn)象。
3. 將混合物(包括沉淀物)轉(zhuǎn)移至純化柱內(nèi),12,000g離心30秒,倒棄收集管內(nèi)液體。
注意:當(dāng)裂解液的體積大于300μl時,在加入等體積結(jié)合液后,總體積會超過純化柱的容量,這時應(yīng)分成2次過柱,即將一半的混合物過柱后,再將剩余的混合物重復(fù)步驟3一次。對于一些特殊的樣品,如出現(xiàn)溶液未完全通過時,可延長離心時間至1-2分鐘,或者加大離心力至16,000g。對于一些能快速啟動達(dá)到12,000g的離心機(jī),離心30秒已經(jīng)足夠,對于一些啟動速度緩慢的離心機(jī)本步驟及后續(xù)步驟中的30秒離心宜調(diào)整為60秒。
4. 加入600μl洗滌液I,12,000g離心30秒,倒棄收集管內(nèi)液體。
5. 加入600μl洗滌液II,12,000g離心30秒,倒棄收集管內(nèi)液體。
6. 重復(fù)步驟5一次。
7. 最高速(約14,000-16,000g)離心2分鐘,去除殘留的液體。
8. 將RNA純化柱置于本試劑盒提供的RNA洗脫管中,加入30-50μl洗脫液,室溫放置2-3分鐘,最高速離心30秒,所得溶液即為純化的RNA。
注意:
洗脫液需要加到純化柱柱面中央,使其被完全吸收。如需獲得更高濃度的樣品,可把洗脫液的體積減小至20μl,但洗脫下來的RNA量會相對減少。室溫較低時,洗脫液在37℃預(yù)熱片刻對得率有所幫助。此外,洗脫后的溶液再次加回到原純化柱再離心洗脫一次,可提高得率約10-30%;或者在第一次洗脫后使用新的洗脫液再洗脫一次,會獲得約為第一次洗脫量15-40%的RNA。​
 

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