Antarctic Phosphatase (Thermosensitive),是一種源自南極微生物的、熱敏感的重組表達(dá)純化的磷酸酶,可以催化去除DNA、RNA、dNTP、rNTP 5'或3’末端磷酸基團(tuán)。DNA或RNA 5’端脫去磷酸基團(tuán)(簡稱脫磷或去磷)后就不能被連接酶(ligase)所連接,常用于避免載體的自連、提高基因克隆時(shí)的陽性率、選擇性連接特定序列等。
Antarctic Phosphatase也可以脫去蛋白質(zhì)絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸殘基上的磷酸基團(tuán)。
Antarctic Phosphatase是一種新型堿性磷酸酯酶,在各種內(nèi)切酶和PCR緩沖液中可保持不低于100%的活性,對于各種類型的DNA 5’末端的去磷酸化均可在37℃孵育15分鐘即可完成,并且75℃孵育5分鐘即可完全失活。
堿性磷酸酶(Alkaline Phosphatase, AP/ALP/AKP/ALKP/ALPase/Alk Phos, EC 3.1.3.1)常被稱作堿性磷酸酯酶,是一類水解酶,通過水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團(tuán)除去,并生成磷酸根離子和自由的羥基。其去磷酸化作用的底物包括核苷酸、蛋白質(zhì)和生物堿等,并在堿性條件下最為有效。該酶是一組同功酶的統(tǒng)稱。常見的小牛腸堿性磷酸酶(Calf Intestinal Alkaline Phosphatase, CIAP/CIP)被廣泛用于二抗等的標(biāo)記,最終用于蛋白和核酸等的檢測,也常用于DNA或RNA 5'和3'末端的去磷酸化(去單磷酸化),特別是質(zhì)粒的5'末端去磷酸化以避免質(zhì)粒自連等。
經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切的質(zhì)粒5'端帶有磷酸基團(tuán),在進(jìn)行基因克隆時(shí)為避免質(zhì)粒自連,可以使用Antarctic Phosphatase去除5'末端磷酸基團(tuán)。脫去5'末端磷酸基團(tuán)的質(zhì)粒不能發(fā)生自連。
本產(chǎn)品主要特點(diǎn):快速去磷酸化,只需37℃孵育15分鐘即可;快速失活,75℃孵育5分鐘即可完全失活;使用方便,在各種內(nèi)切酶和PCR緩沖液中保持不低于100%的活性,可以和質(zhì)粒DNA的酶切等同時(shí)進(jìn)行;兼容性強(qiáng),對于5'或3'突出末端、平端等各種DNA的脫磷酸化采用完全相同的操作步驟;適用于后續(xù)的連接反應(yīng),經(jīng)Antarctic Phosphatase脫磷酸基團(tuán),并75℃孵育5分鐘失活后,通過柱純化或凝膠電泳后切膠回收純化等適當(dāng)處理后,可用于后續(xù)的連接反應(yīng)。
用途:通過去除載體或DNA片段5'末端的磷酸基團(tuán),防止載體或DNA片段自連;質(zhì)粒DNA同時(shí)進(jìn)行內(nèi)切酶消化和脫磷;通過5'末端脫磷,制備用于T4PNK進(jìn)行5'末端標(biāo)記的DNA或RNA;去除DNA、RNA、rNTP和dNTP的5'末端的磷酸基團(tuán);PCR產(chǎn)物中去除dNTP和焦磷酸根;用于蛋白質(zhì)絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸殘基的去磷酸化。
來源:大腸桿菌重組表達(dá)。Antarctic Phosphatase通常會(huì)形成同源二聚體,其單體的分子量為35kD。
酶活性定義: 1µg線性化的pUC19在37℃孵育30分鐘可以導(dǎo)致后續(xù)的自連反應(yīng)抑制率達(dá)到95%以上定義為一個(gè)活力單位。
純度:不含DNA外切酶和內(nèi)切酶,不含RNA酶。
酶儲(chǔ)存溶液:10mM Tris-HCl (pH7.4),1mM MgCl2,0.1mM ZnCl2,50% (v/v) glycerol。
Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X):500mM Bis-Tris-Propane HCl,10mM MgCl2,1mM ZnCl2,pH 6.0。
失活或抑制:75℃加熱5分鐘可使Antarctic Phosphatase充分失活。EDTA等金屬離子螯合劑對Antarctic Phosphatase有抑制作用。
Antarctic Phosphatase75℃滅活前后的酶活對比(參見圖1)。
圖1. 熱敏堿性磷酸酶Antarctic Phosphatase 75℃滅活前后的酶活對比。以pNPP為底物進(jìn)行比色法測定,滅活采用75℃加熱處理5分鐘。反應(yīng)體系為:50µl底物緩沖液(10mM pNPP等),2µl稀釋125倍后的Antarctic Phosphatase (圓形和三角形圖標(biāo)分別代表是否經(jīng)過75℃加熱處理5分鐘的酶)。混勻后室溫反應(yīng)20分鐘,每隔1 min測定一次OD405。
生產(chǎn)的Antarctic Phosphatase對單酶切后的載體進(jìn)行脫磷處理可以大大降低載體單酶切后的自連率(參見圖2)。
圖2. Antarctic Phosphatase對BamHI單酶切后的pUC18載體進(jìn)行脫磷處理可以大大降低載體自連。A. pUC18質(zhì)粒經(jīng)BamHI單酶切過夜,不使用Antarctic Phosphatase進(jìn)行脫磷處理,然后載體用T4 DNA連接酶進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化DH5α的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。B. pUC18質(zhì)粒經(jīng)BamHI單酶切,使用Antarctic Phosphatase在37℃脫磷處理15分鐘,75℃滅活處理5分鐘,然后載體用T4 DNA連接酶進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化DH5α的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。本產(chǎn)品處理后可以使大于95%的單酶切質(zhì)粒脫磷而避免自連。
Antarctic Phosphatase對雙酶切后的載體進(jìn)行脫磷處理可以大大提高克隆的陽性率(參見圖3)。
圖3. Antarctic Phosphatase對EcoRI/BamHI雙酶切后的pUC18載體進(jìn)行脫磷處理可以大大提高克隆的陽性率。A、C. 經(jīng)EcoRI/BamHI雙酶切過夜的pUC18質(zhì)粒未做脫磷處理,加入EcoRI/BamHI雙酶切后600bp的PCR產(chǎn)物片段,然后用T4 DNA連接酶進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化DH5α的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(A)及從該平板挑取10個(gè)單克隆、使用pUC18通用引物、進(jìn)行菌落PCR的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(C);B、D. 經(jīng)EcoRI/BamHI雙酶切的pUC18質(zhì)粒使用Antarctic Phosphatase在37℃脫磷處理15分鐘,75℃滅活處理5分鐘,柱純化后加入經(jīng)EcoRI/BamHI雙酶切的后600bpPCR產(chǎn)物片段,然后用T4 DNA連接酶進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化DH5α的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(B)及從該從平板挑取10個(gè)單克隆、使用pUC18通用引物、進(jìn)行菌落PCR的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(D)。
包裝清單:
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
D7028S-1 | Antarctic Phosphatase (5U/µl) | 200µl |
D7028S-2 | Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X) | 500µl |
— | 說明書 | 1份 |
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
D7028M-1 | Antarctic Phosphatase (5U/µl) | 1ml |
D7028M-2 | Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X) | 2ml |
— | 說明書 | 1份 |
保存條件:
-20℃保存。
注意事項(xiàng):
Antarctic Phosphatase與其它堿性磷酸酶相同,其酶活性需要有Zn2+和Mg2+的存在。反應(yīng)中加入1/10體積的Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X),能夠提供足夠的Zn2+和Mg2+等以保證酶的活性。
Antarctic Phosphatase在NEB buffers 1、2、3、4和CutSmart緩沖液中時(shí),必須同時(shí)加入Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X)才有活性。
Antarctic Phosphatase在單價(jià)鹽離子存在時(shí)活性增強(qiáng)。
Antarctic Phosphatase在EDTA等金屬離子螯合劑、無機(jī)磷酸鹽及磷酸鹽類似物存在時(shí),其活性被抑制。
Antarctic Phosphatase在DTT、巰基乙醇等還原劑存在時(shí),其活性會(huì)降低。
本使用時(shí)宜存放在冰盒內(nèi)或冰浴上,使用完畢后該立即放置于-20℃保存。
本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
使用說明:
1. Antarctic Phosphatase在酶切反應(yīng)中對質(zhì)粒DNA 5'末端去磷酸化:
a.參考如下表格設(shè)置去磷酸化反應(yīng):
質(zhì)粒DNA | 1µg |
內(nèi)切酶的Reaction Buffer (10X) | 2µl |
補(bǔ)充無核酸酶的去離子水 | 至19µl |
內(nèi)切酶 | 1μl |
b.按上述體系設(shè)置好之后,輕輕混勻(可以用移液器吹打混勻或用Vortex在最低速度輕輕混勻一下),隨后離心沉淀液體至管底。
c.37℃孵育60分鐘或根據(jù)內(nèi)切酶說明書推薦的最適條件進(jìn)行酶切反應(yīng)。
d.向酶切體系中加入1µl Antarctic Phosphatase (5U/µl),37℃孵育15分鐘。如果希望獲取更好的去磷酸基團(tuán)效果,也可以延長孵育時(shí)間至60分鐘,但通常孵育15分鐘已經(jīng)足夠。
e.75℃加熱5分鐘,對Antarctic Phosphatase和限制性內(nèi)切酶用熱失活的方法終止反應(yīng)。
f.如果后續(xù)用于連接反應(yīng),可以使用適當(dāng)?shù)腄NA純化試劑盒(D0033)純化或DNA凝膠回收試劑盒(如D0056)進(jìn)行凝膠電泳后的切膠回收純化,也可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法純化已消化并且脫磷酸化的DNA或RNA。
2.DNA、RNA的5'或3'末端脫磷
a.參考如下表格設(shè)置去磷酸化反應(yīng):
待脫磷的DNA或RNA | 1-5µg (up to 10pmol termini) |
Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X) | 2µl |
補(bǔ)充無核酸酶的去離子水 | 至19µ |
Antarctic Phosphatase (5U/μl) | 1μl |
b.按上述體系設(shè)置好之后,輕輕混勻(可以用移液器吹打混勻或用Vortex在最低速度輕輕混勻一下),隨后離心沉淀液體至管底。
c.37℃孵育15分鐘。如果希望獲取更好的去磷酸基團(tuán)效果,也可以延長孵育時(shí)間至60分鐘,但通常孵育15分鐘已經(jīng)足夠。
d.75℃加熱5分鐘失活A(yù)ntarctic Phosphatase。
e.后續(xù)如有必要,可以使用適當(dāng)?shù)腄NA純化試劑盒(如D0033)純化或DNA凝膠回收試劑盒(如D0056)進(jìn)行凝膠電泳后的切膠回收純化,也可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法純化已消化并且脫磷酸化的DNA或RNA。
說明:上述脫磷反應(yīng)可以用于5'突出的DNA,也可以用于平末端DNA,反應(yīng)條件相同,即均為37℃孵育15分鐘。
3.蛋白去磷酸化
a.參考如下表格設(shè)置去磷酸化反應(yīng):
待去磷酸化的蛋白 | 1¬-10µg |
Antarctic Phosphatase Reaction Buffer (10X) | 5µl |
補(bǔ)充去離子水 | 至45µl |
Antarctic Phosphatase (5U/μl) | 5μl |
b.按上述體系設(shè)置好之后,輕輕混勻(可以用移液器吹打混勻或用Vortex在最低速度輕輕混勻一下),隨后離心沉淀液體至管底。
c.37℃孵育60分鐘。
d.加入EDTA至終濃度為50mM或加入釩酸鈉至終濃度為10mM以終止去磷酸化反應(yīng)。
注意:酶的最佳用量和37℃的最佳孵育時(shí)間需根據(jù)特定蛋白自行進(jìn)行優(yōu)化。