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HIV-1 前病毒染料法熒光定量 PCR 試劑盒

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產(chǎn)品及特點

人類免疫缺陷病毒1型(HIV-1)患者血漿中病毒 RNA 水平一直以來是評判抗病毒治療效果或預測疾病進展的重要指標。但是,經(jīng)抗病毒治療后血漿 HIV-1RNA 已達到基線水平感染者的血液、精液或淋巴結中仍可以檢測到 HIV-1原病毒 DNA 的存在,構成病毒儲藏庫,對清除 HIV-1病毒構成嚴重阻礙。所以在病毒載量已經(jīng)檢測不到的情況下,HIV-1原病毒 DNA 水平可以作為除 CD4+T細胞計數(shù)和病毒載量之外的另一標志物。本公司開發(fā) HIV-1 前病毒染料法熒光定量 PCR 試劑盒,它具有下列特點:

1. 即開即用,用戶只需要提供 DNA 模板。

2. 引物根據(jù) HIV-1 前病毒專一區(qū)設計,特異性高。

3. 熒光定量PCR 檢測,比常規(guī) PCR 更加靈敏。

4. 一管式閉管操作,降低了交叉污染。

5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應體系的熒光定量 PCR。

6. 本產(chǎn)品只適用于科研,不能用于臨床診斷。

規(guī)格及成分

 

成分

編號

十孔盒包裝

 

2×qPCR Magic Mix

90408

500 μL棕色管

熒光PCR 專用模板稀釋液

180701

1 mL(黃蓋

HIV-1 前病毒染料法 qPCR 

物混合液

14-22700yw

100 μL(白蓋)

HIV-1 前病毒染料法 qPCR 

性對照(1×10E8 拷貝/μL)

60908-22700pc

50 μL黃蓋

使用手冊

14-22700sc

1 份

運輸及保存

低溫運輸、-20℃保存,有效期一年。

自備試劑

DNA 模板、超純水、10×ROX(根據(jù)機型決定,具體見使用方法)。

使用方法

一、稀釋 PCR 陽性對照 10E2-10E7 拷貝/μL  6  10 倍稀釋度為例)

1.注意:由于陽性對照濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。

2.標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。

3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液最好用帶芯槍頭,下同

4.  7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩 1 分鐘,得

1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。

5. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得)充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。

6. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中,充分


震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。

7. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。二、樣品 DNA 的制備

8. 如果有 N 個樣品,必須設置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對照),

一個是 NC(樣品制備陰性對照?梢杂 10μL PCR 陽性對照的 10000 倍稀釋的(稀釋后濃度為 1×10E4 拷貝/μL10μL 相當于 1 萬拷貝,可以將 10μL 液加入到 990μL 自備 TE 溶液中,充分混勻,此為 100 倍稀釋液。再取 10μL 稀釋液加入到 990μL 自備 TE 溶液中,充分混勻,此為 10000 倍稀釋液)再加上一定量的水作為制備的陽性對照加水后其總體積跟樣品一樣,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求?梢杂盟鳛橹苽涞年幮詫φ。制備所得成為樣品 DNA。

9. 用自選方法純化 N+2 個樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)核酸提取試劑盒兼容。

三、設置 qPCR 反應(20 μL 體系,在樣品制備室進行)

10. 如果做定量分析并且只做 1 次重復,則標記 N+9 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照,6 個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復,則標記 N+4 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照用水做模板),1 個用于 PCR 陽性對照(用 4 號陽性對照稀釋液,濃度為 10E4 拷貝/μL)。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把 6 個標曲反應縮減成 1 個,其余不變。

11. 
在標記管中按下表加入各成分本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置:ABI75007700  7900 儀器需要使用 ROX 作為對照,其他熒光 PCR (如 iCycler IQMJ Option、MJ Chromo4、MX3000MX4000、RotorGene


 

3000RotorGene 6000  LightCycler480不需要使用 ROX,則用水替代。

12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化。

四、數(shù)據(jù)處理

13. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 cDNA 濃度的log 值,再推算出其濃度。

14. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等36。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 35 則為陰性,如果小于或等于 30 則為陽性。如果在 30-35 之間,則重復一次。若重復結果 Ct 值小于 35,擴增曲線有

明顯起峰,該樣本判斷為陽性,否則為陰性。

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