產(chǎn)品及特點
支原體和親緣關(guān)系很近的無膽甾原體、螺旋體統(tǒng)稱霉形體。霉形體是目前發(fā)現(xiàn)的最小的、最簡單的原核生物。它們?nèi)狈毎凇⒂凶冃文芰、能通過濾菌器、 可在無生命培養(yǎng)基中生長繁殖,成為細胞培養(yǎng)中常見的一種污染源,嚴重影響細胞生長率、細胞形態(tài)、基因表達、細胞代謝和細胞活力。因此快速靈敏檢測支原體具有重要意義。本產(chǎn)品就是為此目的根據(jù) PCR 原理開發(fā)的試劑盒,它具有下列特點:
1.即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板。
2.引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
3.提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4.特異性高,引物是根據(jù)支原體高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他微生物的 DNA 發(fā)生交叉反應。
5.本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 PCR 反應。
6.本產(chǎn)品只能用于科研。
成份 | 編號 | 十孔盒包裝 |
PCR MagicMix 3.0 | 90805 | 1 mL(紅蓋) |
超純水 | 100935 | 1 mL(亮黃蓋) |
支原體通用 PCR 引物混合液 | 13-74000yw | 100 μL(白蓋) |
支原體通用 PCR 陽性對照 (1×10E8 拷貝/μL) | 13-74000pc | 50 μL(黃蓋) |
運輸及保存:低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月。
自備試劑:樣品 DNA。
使用方法:
一、稀釋標準曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。
由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原, 本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。
1.標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2.用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
3.在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
4.換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用
5.換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用
6.重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。二、樣品 DNA 的制備
7.如果有 N 個樣品,最好設(shè)置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)?梢杂 10μL 陽性對照的 10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為 NC。
8.用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù) DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的核酸釋放劑,使用后其裂解液可以直接作為 PCR 模板,省略了 DNA 提取步驟。
三、Probe qPCR 反應(20μL 體系,在樣品制備室進行)
9.如果做定量分析并且只做 1 次重復,則標記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),6 個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復,則標記 N+4 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1 個用于 PCR 陽性對照(用第 4 號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10.在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設(shè) 置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好
后最后加):
成分 | N+2 個 樣品管 | PCR 陰性 對照管 | PCR 陽性 對照管 |
PCR MagicMix 3.0 | 各 20 μL | 20 μL | 20 μL |
支原體通用 PCR 引物混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 2 μL |
N+2 個樣品 DNA 模板 | 各 18 μL | - | - |
PCR 陰性對照(超純水) | - | 18 μL | - |
PCR 陽性對照(支原體通用 PCR 陽 性對照的 10000 倍稀釋液) | - | - | 18 μL |
12.蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行 PCR:
過程 | 溫度 | 時間 |
預變性 | 95℃ | 5 min |
PCR 反應 (35 個循環(huán)) | 95℃ | 30 sec |
| 55℃ | 30 sec |
| 72℃ | 60 sec |
最后延伸 | 72℃ | 10 min |
四、數(shù)據(jù)處理
12.如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品RNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。
13.如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 34。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 34 則為陰性,如果小于或等于 30則為陽性。如果在 30-34之間,則重復一次。重復實驗的 Ct值,如果大于或等于 34 則為陰性,如果小于 30,則為陽性。