1. 即開即用,用戶只需要提供 DNA 模板。
2. 特異性高,引物是根據(jù)鼠疫耶爾森菌高度保守區(qū)設(shè)計,不會擴(kuò)增其他細(xì)菌。
3. 引物和擴(kuò)增體系經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性比常規(guī) PCR 高 100 倍。
4. 提供無傳染性的 PCR 陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
5. 一管式操作,熒光 PCR 檢測,不容易產(chǎn)生環(huán)境污染。
本產(chǎn)品只能用于科研,本試劑盒足夠 50 次 20μL 體系的 PCR
成分 | 編號 | 十孔盒包裝 |
2×qPCR MagicMix | 90408 | 0.5 mL(棕色) |
熒光 PCR 專用模板稀釋液 | 180701 | 1 mL(亮黃蓋) |
鼠疫耶爾森菌 PCR 引物混合液 | 14-29420yw | 100 μL(白蓋) |
鼠疫耶爾森菌 PCR 陽性對照 (1×10E8 拷貝/μL) | 14-29420pc | 50 μL(紅蓋) |
天凈沙核酸釋放劑試用裝 | 61202 | 20 次(1mL,綠蓋) |
使用手冊 | 14-29420sc | 1 份 |
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月
一、制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能
污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原, 本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。1.標(biāo)記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
在 7 號管中加入 5 μL 陽性對照(其濃度為 1×10E8 拷貝/μL,試劑盒提
供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
重復(fù)上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用
4. 二、樣品 DNA 的制備
5. 用自選方法純化樣品的 DNA,本產(chǎn)品跟市場上絕大多數(shù)核酸純化產(chǎn)品兼容。
6. 如果有 N 個樣品,則需要進(jìn)行 N+2 個樣品提取,多出的一個用作樣品制備陽性對照管、另一個用作樣品制備陰性對照管。本試劑盒免費(fèi)贈送 20 次免DNA 提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為PCR 模板,省略了 DNA 提取步驟。
三、設(shè)置 qPCR 反應(yīng)(20μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行)
7. 如果進(jìn)行定量分析,則標(biāo)記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照,6 個用于標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。如果做定性分析,則 6 個標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品只選一個做(可以選 4 號,其余樣品不變)。以下只介紹定量分析的反應(yīng)設(shè)置。
在標(biāo)記管中按下表加入各成分:
成分 | N+2 個 樣品管 | PCR 陰性 對照管 | 標(biāo)準(zhǔn)曲線 樣品管(2-7 管) |
2×qPCR MagicMix | 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
鼠疫耶爾森菌 PCR 引物混合液 | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
自備 10×ROX (見注) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
N+2 個待測樣品 DNA 模板 | 6 μL | 不加 | 不加 |
自備超純水 | 不加 | 6 μL | 不加 |
第 7 步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液 (2-7 號) |
不加 |
不加 | 各 6μL(2 號樣到 2 號管,3 號樣到 3 號管…) |
注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照,其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、 RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480) 不需要使用 ROX,則用水替代。
4. 蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同
過程 | 溫度 | 時間 |
預(yù)變性 | 94℃ | 5 min |
PCR 反應(yīng) (40 個循環(huán)) | 94℃ | 0.5 min |
| 50℃ | 0.5 min(采集 SYBR 通道的 熒光信號) |
| 72℃ | 0.5 min |
最后延伸 | 72℃ | 10 min |
五、數(shù)據(jù)處理
12. 設(shè)定 60℃-96℃范圍的融解曲線分析,排除假陽性。
13. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。
14. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的 Ct
值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 40,則為陽性。