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鼠疫耶爾森菌(鼠疫桿菌)染料法熒光定量 PCR 試劑盒

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 鼠疫耶爾森菌(鼠疫桿菌)染料法熒光定量 PCR 試劑盒鼠疫的病原菌,鼠疫一種人獸共患的自然疫源性烈性傳染病,人類鼠疫多為疫鼠的跳蚤叮咬而感染, 是我國法定的甲類傳染病。此菌引起的是嚙齒動物中的自然疫源性疾病,傳染性強(qiáng),病死率高,易釀成大流行,此菌主要累及皮膚和淋巴結(jié),其次為敗血癥、肺炎、腦膜炎,對人體健康有較大危害,因此快速檢測鼠疫耶爾森菌(鼠疫桿菌)具  有重要意義。熒光定量 PCR 是檢測傳染性疾病的主流技術(shù),本產(chǎn)品就是以染料法熒光定量PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測鼠疫耶爾森菌(鼠疫桿菌)的試劑盒, 它具有下列特點(diǎn):

1. 即開即用,用戶只需要提供 DNA 模板。

2. 特異性高,引物是根據(jù)鼠疫耶爾森菌高度保守區(qū)設(shè)計,不會擴(kuò)增其他細(xì)菌。

3. 引物和擴(kuò)增體系經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性比常規(guī) PCR  100 倍。

4. 提供無傳染性的 PCR 陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。

5. 一管式操作,熒光 PCR 檢測,不容易產(chǎn)生環(huán)境污染。

本產(chǎn)品只能用于科研,本試劑盒足夠 50  20μL 體系的 PCR

 

成分

編號

十孔盒包裝

2×qPCR MagicMix

90408

0.5 mL(棕色)

熒光 PCR 專用模板稀釋液

180701

1 mL(亮黃蓋)

鼠疫耶爾森菌 PCR 引物混合液

14-29420yw

100 μL白蓋)

鼠疫耶爾森菌 PCR 陽性對照

(1×10E8 拷貝/μL)

14-29420pc

50 μL紅蓋)

天凈沙核酸釋放劑試用裝

61202

20 次(1mL,綠蓋)

使用手冊

14-29420sc

1 份

 

低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月

一、制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品 10E2-10E7 拷貝/μL  6  10 倍稀釋度為例。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能

污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原, 本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。1.標(biāo)記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。

2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。

 

 7 號管中加入 5 μL 陽性對照(其濃度為 1×10E8 拷貝/μL,試劑盒提


),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

 

重復(fù)上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用

4. 二、樣品 DNA 的制備

5. 用自選方法純化樣品的 DNA,本產(chǎn)品跟市場上絕大多數(shù)核酸純化產(chǎn)品兼容。

6. 如果有 N 個樣品,則需要進(jìn)行 N+2 個樣品提取,多出的一個用作樣品制備陽性對照管、另一個用作樣品制備陰性對照管。本試劑盒免費(fèi)贈送 20 次免DNA 提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為PCR 模板,省略了 DNA 提取步驟。

三、設(shè)置 qPCR 反應(yīng)(20μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行)

7. 如果進(jìn)行定量分析,則標(biāo)記 N+9  PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的N+2 個樣品1 個用于 PCR 陰性對照,6 個用于標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。如果做定性分析,則 6 個標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品只選一個做(可以選 4 號,其余樣品不變)。以下只介紹定量分析的反應(yīng)設(shè)置。

 

在標(biāo)記管中按下表加入各成分:

 

成分

N+2 個

樣品管

PCR 陰性

對照管

標(biāo)準(zhǔn)曲線

樣品管(2-7 管)

2×qPCR MagicMix

10 μL

10 μL

 10 μL

鼠疫耶爾森菌 PCR 引物混合液

2 μL

2 μL

 2 μL

自備 10×ROX (見注)

2 μL

2 μL

 2 μL

N+2 個待測樣品 DNA 模板

6 μL

不加

不加

自備超純水

不加

6 μL

不加

第 7 步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液

(2-7 號)

 

不加

 

不加

 6μL2 號樣到 2 號管,3 號樣到 3

號管…)

 

: ABI75007700  7900 儀器需要使用 ROX 作為對照,其他熒光 PCR 儀器 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000MX4000、 RotorGene 3000、RotorGene 6000  LightCycler480 不需要使用 ROX,則用水替代。

4. 蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同

 

過程

溫度

時間

預(yù)變性

94℃

5 min

 

PCR 反應(yīng)

(40 個循環(huán))

94℃

0.5 min

 

50℃

0.5 min采集 SYBR 通道的

熒光信號)

 

72℃

0.5 min

最后延伸

72℃

10 min

 

五、數(shù)據(jù)處理

12. 設(shè)定 60℃-96℃范圍的融解曲線分析,排除假陽性。

13. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。

14. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的 Ct

值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 40,則為陽性。

 

 

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