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T7體外轉(zhuǎn)錄試劑盒

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產(chǎn)品及特點(diǎn)
本試劑盒是基于 T7 RNA 聚合酶的 RNA 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒,它利用含有 T7 啟動(dòng)子的模版 DNA,以 NTP 為底物,從 T7 啟動(dòng)子下游開始合成與模版 DNA 中一條鏈互補(bǔ)的 RNA,簡(jiǎn)單快速獲得大量的 RNA 分子。本產(chǎn)品具有下列特點(diǎn):
1.即開即用,用戶只需提供含 T7 啟動(dòng)子的 DNA 模板即可以進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn), 不需要單獨(dú)準(zhǔn)備每一個(gè)成份。
2.單溶液預(yù)配液,減少加樣次數(shù),避免了操作誤差,增加了可重復(fù)性。
3.模版 DNA 可以是線性化的質(zhì)粒 DNA,也可以是 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物。
4.可以合成的 RNA 的最佳長(zhǎng)度在 20nt 到 2000 nt 之間。
5.產(chǎn)品配方經(jīng)過精心優(yōu)化,每 ug DNA 模版可以合成 2-6 ug RNA。
6.得到的 RNA 可以用于 RNA 結(jié)構(gòu)研究、核酶生物化學(xué)、體外翻譯、RNA-蛋白質(zhì)相互作用、反義技術(shù)、SELEX 技術(shù)和 RNA 干擾(RNAi)等實(shí)驗(yàn)。
7.本試劑盒足夠 50 次 20μL 體系的體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),并且只能用于科研。
規(guī)格及成分:

成份

編號(hào)

十孔盒包裝

T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液,2×

91106a

0.5 mL(綠色蓋

T7 RNA 聚合酶-RI 混合液

91106c

50 μL黃色蓋

RNase-free 水

80403

1 mL(藍(lán)色蓋)

使用手冊(cè)

91106sc

1 份

 

運(yùn)輸及保存低溫運(yùn)輸,-20℃保存、有效期一年。

自備試劑Tris 飽和酚、氯仿、RNase-free 75%乙醇(均可從本公司另購)

 相關(guān)資料一、制備 DNA 模板(本試劑盒不含所需試劑,此處信息僅供參考)PCR 片段和質(zhì)粒DNA 都可以用作體外轉(zhuǎn)錄的模板,但是必須注意以下幾點(diǎn)。

一是必須使用線性化的DNA。如果是質(zhì)粒DNA,則必須先用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶切成線狀。

二是需要轉(zhuǎn)錄的DNA 序列的上游必須有T7 啟動(dòng)子。如果模板是PCR 產(chǎn)物,則可以在設(shè)計(jì)引物時(shí)將T7 啟動(dòng)子序列(5’TAATAC GAC TCA CTA TAG GG3’)加上。如果是將DNA 片段克隆到載體上,則需要選擇有T7 啟動(dòng)子的載體,并且克隆位點(diǎn)必須位于T7 啟動(dòng)子下游。

三是需要轉(zhuǎn)錄的DNA 序列的下游端最好不要是3’突出。如果是3’突出(比如選擇了 Pst I 來線性化質(zhì)粒),則最好用 T4 DNA 聚合酶修平。


        四是必須保證DNA 模板中沒有RNase。由于提取質(zhì)粒DNA 的過程中一般要使用大量的RNaseA,因此質(zhì)粒DNA 一般都有嚴(yán)重的RNase A 污染,所以在用作模板前,最好采取膠回收得方法回收質(zhì)粒DNA。并且加入少量總RNA 一起保溫,然后電泳檢測(cè)RNA 是否被降解,以此來判斷純化的DNA 模板是否有殘留RNase A。如果有RNase 污染,則必須反復(fù)酚-氯仿抽提去除殘留的RNase,然后再乙醇沉淀質(zhì)粒DNA。
二、體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)1. 如果有N 個(gè)樣品,強(qiáng)烈建議做一個(gè)陰性對(duì)照,故共設(shè)置N+1 個(gè)反應(yīng),這樣一起并排電泳時(shí)容易判斷哪個(gè)條帶是模板DNA,哪個(gè)條帶是擴(kuò)增得到的RNA。在 N+1 個(gè) RNase-free 的塑料離心管中,在室溫下(不是在 4℃下)按次序加入下列成分(T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液容易產(chǎn)生結(jié)晶沉淀,一定要握在手中直到結(jié)晶徹底溶解并搖勻后方可使用): 

成分

N 個(gè)樣品管

陰性對(duì)照管

DNA 模板

50 ng 左右的 PCR 片段

1 ug 左右的線狀質(zhì)粒

不加

T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液,2×

 10 μL

10 μL

T7 RNA 聚合酶-RI 混合液

 1 μL

1 μL

補(bǔ) RNase-free 水到

20μL

20μL

注:此為 20μL 反應(yīng)體系的用量,對(duì)其他反應(yīng)體系,各成分的用量可以按比例增減。本產(chǎn)品的 T7 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液已經(jīng)含有 NTP。如果需要標(biāo)記 RNA 探針或制備帶帽 RNA,則需要訂購NTP 分開的試劑盒。
2.37℃保溫 1-2 小時(shí)。注意:延長(zhǎng)保溫時(shí)間并不能大幅提高產(chǎn)量。
3.加入 2μL 自備的 500mM 的 EDTA 溶液滅活 T7 RNA 聚合酶。
4.取 1-3 μL 電泳,此時(shí)最好用 DNA 模板做電泳對(duì)照。電泳時(shí)比陰性對(duì)照多出的條帶就是擴(kuò)增得到的 RNA(由于合成的 RNA 長(zhǎng)度不均勻,即使長(zhǎng)度均勻, 但由于自生形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),泳動(dòng)速度也不一致,所以電泳所得 RNA 條帶一般都不是清晰,而是比較彌散的電泳條帶。但由于 RNA 是單鏈,分子量比同樣 長(zhǎng)度的 DNA 小一倍,因此 RNA 一般比其雙鏈 DNA 模板電泳速度更快。
5.定量,可以用自備的單鏈 RNA 定量試劑盒檢測(cè)濃度。不推薦使用電泳定量。使用本試劑盒時(shí) 1μg DNA 模板一般可以合成 2-6μg 的 RNA。
得到的 RNA 可以放-80℃保存。如需去除 DNA 模板,請(qǐng)按下面步驟操作。
三、去除 DNA 模板(所需試劑需要另購)
7.在 20μL 體積的體外轉(zhuǎn)錄體系中加入 2μL 的 10×DNase Buffer 和 1 μL 自備的 RNase-free DNase(3-5 U/μL)。
8.37℃保溫 30 分鐘。
9.補(bǔ) RNase-free 水到 100 μL。增加體積可以減少樣品的丟失。
10.用自備的等體積(100 μL)的 Tris 飽和酚-氯仿,震蕩混勻后 14000g 離心3 分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到新的離心管中。此步去除 DNase 和 RNA 聚合酶。
11.加自備的 200 μL 無水乙醇和 10μL 3M 的乙酸鈉溶液(pH5.2),振蕩后14000 rpm 離心 20 分鐘,RNA 形成沉淀,棄上清。
12.在沉淀中加入 1 mL 75%乙醇,震蕩 10 秒后 14000g 離心 5 分鐘,棄上清。
13.短暫離心數(shù)秒,用槍頭吸棄上清。不要丟失沉淀。晾干,所得沉淀即體外轉(zhuǎn)錄所得的 RNA
 

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