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pET-N-His-TEV-QUEEN2m (細菌ATP熒光探針)

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 ET-N-His-TEV-QUEEN2m (細菌ATP熒光探針)是研發(fā)的一種用于在細菌中表達N端含有His標簽(His tag)的QUEEN2m融合蛋白以作為ATP熒光探針的原核工具質(zhì)粒,可以用于活體實時檢測單個細菌內(nèi)ATP水平或QUEEN2m的原核表達純化。

QUEEN (Quantitative Evaluator of Cellular Energy)是一個單一的環(huán)狀排列的熒光蛋白(circularly-permuted fluorescent protein)和細菌ATP結合蛋白融合表達而成。QUEEN對細菌生長速率的改變不敏感(insensitive to bacteria growth changes)。許多細菌細胞內(nèi)根據(jù)QUEEN的熒光所計算的胞內(nèi)ATP濃度與根據(jù)螢火蟲熒光素酶(firefly luciferase)方法檢測所計算得出的胞內(nèi)ATP濃度幾乎完全一致,因此QUEEN適合用于定量檢測細菌內(nèi)的絕對ATP濃度。從很多單個細菌收集的QUEEN熒光信號進行分析時發(fā)現(xiàn),即使是遺傳背景相同的大腸桿菌細胞,在相同培養(yǎng)條件下,細胞內(nèi)的絕對ATP濃度也是不同的。

基因編碼的ATP熒光探針QUEEN7µ熒光蛋白,由環(huán)型排列的增強型綠色熒光蛋白cpEGFP (circularly-permuted enhanced green fluorescent protein)插入到嗜熱芽孢桿菌(thermophilic Bacillus) PS3的FoF1-ATP合成酶的ε亞基的兩個α螺旋之間組成,在接頭處分別由兩個氨基酸的接頭(TR和LG)進行連接。當ATP結合于FoF1-ATP合成酶的ε亞基的時候,會引起整個蛋白發(fā)生構象變化。激發(fā)波長400nm/發(fā)射波長513nm的熒光強度與激發(fā)波長494nm/發(fā)射波長513nm的熒光強度的比值對ATP的濃度變化做出響應。QUEEN7µ是一個高親和力的ATP熒光探針(Kd~7µM at 25℃),但對ADP沒有親和力。對于正常的活細菌而言,QUEEN7µ對ATP的親和力可能過高,而較難檢測出較高濃度ATP水平的變化。但對于特定條件導致的細菌內(nèi)低ATP水平時,比較適合使用QUEEN7µ進行ATP的熒光檢測。也可以使用表達純化的QUEEN7µ進行體外體系的ATP實時濃度檢測。

基因編碼的ATP熒光探針QUEEN2m熒光蛋白,是QUEEN7µ的突變體,通過用源自枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的FoF1-ATP合成酶的ε亞基的1-107aa取代QUEEN7µ中的源自嗜熱芽孢桿菌(thermophilic Bacillus) PS3的FoF1-ATP合成酶ε亞基的1-107aa。仍然以激發(fā)波長400nm/發(fā)射波長513nm的熒光強度與激發(fā)波長494nm/發(fā)射波長513nm的熒光強度的比值對ATP的濃度變化做出響應。但QUEEN2m是一個低親和力的ATP熒光探針,更適合檢測ATP的生理濃度(Kd~4.5mM at 25℃)。高濃度的ADP會對QUEEN2m信號產(chǎn)生負面影響,但效果相對較小(在生理ADP濃度下約為10%或更少)。此外QUEEN2m信號在pH7.3-8.8和生理Mg2+濃度(1-2mM)范圍內(nèi)幾乎不受影響。

圖1.QUEEN7µ、QUEEN2m和QUEEN NA的蛋白結構圖。

本質(zhì)粒含有T7啟動子/lac操縱子,可以在異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)的誘導下高效啟動目的蛋白表達。在多克隆位點的前面,帶有一個His標簽的編碼序列,含有6個組氨酸(6X His)。

本載體在N端His標簽與多克隆位點之間含有TEV蛋白酶(TEV Protease)識別的七肽序列ENLYFQG,對應的核酸序列為GAGAACCTGTACTTCCAAGGG,因此可在QUEEN2m蛋白純化后用TEV蛋白酶切除N端His標簽。TEV蛋白酶酶切發(fā)生在七肽序列的Q和G之間,因此在酶切去除His標簽的時候目的蛋白的N端會留下一個額外的氨基酸殘基G。

本質(zhì)粒為卡那霉素抗性。

pET-N-His-TEV-QUEEN2m質(zhì)粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
f1 origin 12-467
Kanamycin resistance ORF 563-1645
PBR 322 origin 2084
LacI coding sequence 3518-4597
T7 promoter 4988-5004
His tag coding sequence 5079-5096
TEV Protease recognition site sequence 5097-5117
QUEEN2m 5124-6266
T7 Terminator 6364-6410

pET-N-His-TEV-QUEEN2m質(zhì)粒(6417bp)的圖譜如下:

pET-N-His-TEV-QUEEN2m中沒有的酶切位點(Restriction enzymes that do not cut pET-N-His-TEV-QUEEN2m)包括:

AatII Acc65I AflII AgeI AhdI AscI AvrII
BaeI BbvCI BfuAI BmgBI BmtI BsaI BsiWI
BspMI BstBI Bsu36I CspCI DraI EagI Eco53kI
EcoRI FseI HindIII KpnI MfeI MscI NcoI
NheI NotI PacI PmeI PmlI PspXI PstI
RsrII SacI SacII SalI SbfI ScaI SexAI
SfiI SnaBI SpeI SrfI StuI SwaI ZraI

pET-N-His-TEV-QUEEN2m中的單酶切位點(Restriction enzymes that cut pET-N-His-TEV-QUEEN2m)包括:

AlwNI CAG,NNN`CTG 1729 NdeI CA`TA,TG 5074
AsiSI GCG,AT`CGC 943 NruI TCG|CGA 1286
BamHI G`GATC,C 5118 PaeR7I C`TCGA,G 6273
BclI T`GATC,A 4228 PciI A`CATG,T 2141
BglII A`GATC,T 6267 PflFI GACN`N,NGTC 2399
BseRI GAGGAG(N)8,NN` 5779 PpuMI RG`GWC,CY 3136
BspQI GCTCTTCN`NNN, 2258 PshAI GACNN|NNGTC 3401
BsrGI T`GTAC,A 5725 PsiI TTA|TAA 370
BssHII G`CGCG,C   3831 PvuI CG,AT`CG   943
BstAPI GCAN,NNN`NTGC   4563 SapI GCTCTTCN`NNN,  2258
BstEII G`GTNAC,C 4060 SgrAI CR`CCGG,YG   4923
BstZ17I GTA|TAC 2374 SmaI CCC|GGG 1069
DraIII CAC,NNN`GTG 242 SphI G,CATG`C 4771
EcoRV GAT|ATC 5180 TspMI C`CCGG,G   1067
FspI TGC|GCA 3164 Tth111I GACN`N,NGTC 2399
HincII GTY|RAC 3740 XbaI T`CTAG,A 5034
HpaI GTT|AAC 3740 XhoI C`TCGA,G 6273
MluI A`CGCG,T 4242 XmaI C`CCGG,G 1067

包裝清單:

產(chǎn)品編號 產(chǎn)品名稱 包裝
D2906-1μg pET-N-His-TEV-QUEEN2m 1μg
D2906-100μg pET-N-His-TEV-QUEEN2m 100μg
說明書 1份

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-20℃保存。

注意事項:

本質(zhì)粒未經(jīng)書面許可不得用于任何商業(yè)用途,也不得移交給訂貨人所在實驗室外的任何個人或單位。

本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。

為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

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