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pET-N-His-TEV-QUEEN NA (ATP熒光探針對照質(zhì)粒)

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 pET-N-His-TEV-QUEEN NA (ATP熒光探針對照質(zhì)粒)是研發(fā)的一種用于在細(xì)菌中表達(dá)ATP熒光探針QUEEN2m或QUEEN7µ時,作為對照的原核工具質(zhì)粒,可以用于活體實(shí)時檢測單個細(xì)菌內(nèi)ATP水平時的對照,也可以用于QUEEN NA的原核表達(dá)純化。

QUEEN (Quantitative Evaluator of Cellular Energy)是一個單一的環(huán)狀排列的熒光蛋白(circularly-permuted fluorescent protein)和細(xì)菌ATP結(jié)合蛋白融合表達(dá)而成。QUEEN對細(xì)菌生長速率的改變不敏感(insensitive to bacteria growth changes)。許多細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)根據(jù)QUEEN的熒光所計算的胞內(nèi)ATP濃度與根據(jù)螢火蟲熒光素酶(firefly luciferase)方法檢測所計算得出的胞內(nèi)ATP濃度幾乎完全一致,因此QUEEN適合用于定量檢測細(xì)菌內(nèi)的絕對ATP濃度。從很多單個細(xì)菌收集的QUEEN熒光信號進(jìn)行分析時發(fā)現(xiàn),即使是遺傳背景相同的大腸桿菌細(xì)胞,在相同培養(yǎng)條件下,細(xì)胞內(nèi)的絕對ATP濃度也是不同的。

基因編碼的ATP熒光探針QUEEN7µ熒光蛋白,由環(huán)型排列的增強(qiáng)型綠色熒光蛋白cpEGFP (circularly-permuted enhanced green fluorescent protein)插入到嗜熱芽孢桿菌(thermophilic Bacillus) PS3的FoF1-ATP合成酶的ε亞基的兩個α螺旋之間組成,在接頭處分別由兩個氨基酸的接頭(TR和LG)進(jìn)行連接。當(dāng)ATP結(jié)合于FoF1-ATP合成酶的ε亞基的時候,會引起整個蛋白發(fā)生構(gòu)象變化。激發(fā)波長400nm/發(fā)射波長513nm的熒光強(qiáng)度與激發(fā)波長494nm/發(fā)射波長513nm的熒光強(qiáng)度的比值對ATP的濃度變化做出響應(yīng)。QUEEN7µ是一個高親和力的ATP熒光探針(Kd~7µM at 25℃),但對ADP沒有親和力。對于正常的活細(xì)菌而言,QUEEN7µ對ATP的親和力可能過高,而較難檢測出較高濃度ATP水平的變化。但對于特定條件導(dǎo)致的細(xì)菌內(nèi)低ATP水平時,比較適合使用QUEEN7µ進(jìn)行ATP的熒光檢測。也可以使用表達(dá)純化的QUEEN7µ進(jìn)行體外體系的ATP實(shí)時濃度檢測。

基因編碼的ATP熒光探針QUEEN2m熒光蛋白,是QUEEN7µ的突變體,通過用源自枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的FoF1-ATP合成酶的ε亞基的1-107aa取代QUEEN7µ中的源自嗜熱芽孢桿菌(thermophilic Bacillus) PS3的FoF1-ATP合成酶ε亞基的1-107aa。仍然以激發(fā)波長400nm/發(fā)射波長513nm的熒光強(qiáng)度與激發(fā)波長494nm/發(fā)射波長513nm的熒光強(qiáng)度的比值對ATP的濃度變化做出響應(yīng)。但QUEEN2m是一個低親和力的ATP熒光探針,更適合檢測ATP的生理濃度(Kd~4.5mM at 25℃)。高濃度的ADP會對QUEEN2m信號產(chǎn)生負(fù)面影響,但效果相對較小(在生理ADP濃度下約為10%或更少)。此外QUEEN2m信號在pH7.3-8.8和生理Mg2+濃度(1-2mM)范圍內(nèi)幾乎不受影響。

基因編碼的ATP探針QUEEN NA熒光蛋白,是QUEEN2m的突變體,使用源自枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的FoF1-ATP合成酶的ε亞基的110-132aa取代QUEEN2m中的源自嗜熱芽孢桿菌(thermophilic Bacillus) PS3的FoF1-ATP合成酶ε亞基的110-133aa,并突變了兩個位點(diǎn)(R122K/R126K),使QUEEN-NA失去了對ATP的親和作用。因此QUEEN NA可用作QUEEN2m或QUEEN 7µ的陰性對照。

圖1.QUEEN7µ、QUEEN2m和QUEEN NA的蛋白結(jié)構(gòu)圖。

本質(zhì)粒含有T7啟動子/lac操縱子,可以在異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)的誘導(dǎo)下高效啟動目的蛋白表達(dá)。在多克隆位點(diǎn)的前面,帶有一個His標(biāo)簽的編碼序列,含有6個組氨酸(6X His)。

本載體在N端His標(biāo)簽與多克隆位點(diǎn)之間含有TEV蛋白酶(TEV Protease)識別的七肽序列ENLYFQG,對應(yīng)的核酸序列為GAGAACCTGTACTTCCAAGGG,因此可在QUEEN NA蛋白純化后用TEV蛋白酶切除N端His標(biāo)簽。TEV蛋白酶酶切發(fā)生在七肽序列的Q和G之間,因此在酶切去除His標(biāo)簽的時候目的蛋白的N端會留下一個額外的氨基酸殘基G。。

本質(zhì)粒為卡那霉素抗性。

pET-N-His-TEV-QUEEN NA質(zhì)粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
f1 origin 12-467
Kanamycin resistance ORF 563-1645
PBR 322 origin 2084
LacI coding sequence 3518-4597
T7 promoter 4988-5004
His tag coding sequence 5079-5096
TEV Protease recognition site sequence 5097-5117
QUEEN NA 5124-6269
T7 Terminator 6367-6413

pET-N-His-TEV-QUEEN NA質(zhì)粒(6420bp)的圖譜如下:

 

pET-N-His-TEV-QUEEN NA中沒有的酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that do not cut pET-N-His-TEV-QUEEN NA)包括:

AatII Acc65I AflII AgeI AhdI AscI AvrII
BaeI BbvCI BfuAI BmtI BsaI BsiWI BspMI
BstBI Bsu36I CspCI DraI EagI Eco53kI EcoRI
FseI HindIII KpnI MfeI MscI NcoI NheI
NotI PacI PmeI PmlI PspXI RsrII SacI
SacII SalI SbfI ScaI SexAI SfiI SnaBI
SpeI SrfI StuI SwaI ZraI    

pET-N-His-TEV-QUEEN NA中的單酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that cut pET-N-His-TEV-QUEEN NA)包括:

AlwNI CAG,NNN`CTG 1729 NdeI CA`TA,TG 5074
AsiSI GCG,AT`CGC 943 NruI TCG|CGA 1286
BamHI G`GATC,C 5118 PaeR7I C`TCGA,G 6276
BclI T`GATC,A 4228 PciI A`CATG,T 2141
BglII A`GATC,T 6270 PflFI GACN`N,NGTC 2399
BmgBI CAC|GTC 6248 PpuMI RG`GWC,CY 3136
BseRI GAGGAG(N)8,NN` 5779 PshAI GACNN|NNGTC 3401
BspQI GCTCTTCN`NNN, 2258 PsiI TTA|TAA 370
BsrGI T`GTAC,A 5725 PstI C,TGCA`G 6222
BssHII G`CGCG,C 3831 PvuI CG,AT`CG 943
BstAPI GCAN,NNN`NTGC 4563 SapI GCTCTTCN`NNN, 2258
BstEII G`GTNAC,C 4060 SgrAI CR`CCGG,YG 4923
BstZ17I GTA|TAC 2374 SmaI CCC|GGG 1069
DraIII CAC,NNN`GTG 242 SphI G,CATG`C 4771
EcoRV GAT|ATC 5180 TspMI C`CCGG,G 1067
FspI TGC|GCA 3164 Tth111I GACN`N,NGTC 2399
HincII GTY|RAC 3740 XbaI T`CTAG,A 5034
HpaI GTT|AAC 3740 XhoI C`TCGA,G 6276
MluI A`CGCG,T 4242 XmaI C`CCGG,G 1067

包裝清單:

產(chǎn)品編號 產(chǎn)品名稱 包裝
D2909-1μg pET-N-His-TEV-QUEEN NA 1μg
D2909-100μg pET-N-His-TEV-QUEEN NA 100μg
說明書 1份

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-20℃保存。

注意事項:

本質(zhì)粒未經(jīng)書面許可不得用于任何商業(yè)用途,也不得移交給訂貨人所在實(shí)驗室外的任何個人或單位。

本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。

為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗服并戴一次性手套操作。

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