使用口腔拭子基因組DNA提取試劑盒回收的DNA可適用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、文庫構(gòu)建、 Southern雜交等實(shí)驗(yàn)。
注意事項(xiàng) 請務(wù)必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項(xiàng)。 1.若緩沖液GA或GB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,搖勻后使用。 2.所有離心步驟均使用臺式離心機(jī),室溫下離心。
操作步驟
使用前請先在緩沖液GD和漂洗液PW中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶上的標(biāo)簽。
取樣方式:使用棉簽在面頰內(nèi)擦拭10次。
注意:為了保證樣本不被食物或者飲料污染,取樣前 30 min內(nèi)請勿進(jìn)食和飲水。
1. 處理材料:
將在面頰內(nèi)擦拭過的棉簽轉(zhuǎn)置于2 ml離心管中,用剪刀將棉簽部分從其桿上剪下,加入400 μl緩沖液GA。
注意:如果需要去除RNA,可加入4 μl RNase A(100 mg/ml)溶液(客戶自備,目錄號:RT405-12),振蕩15 sec,室溫放置5 min。
2. 加入20 μl Proteinase K溶液,渦旋10 sec混勻,56℃放置60 min,其間每15 min渦旋混
勻數(shù)次。
3. 加入400 μl緩沖液GB,充分顛倒混勻,70℃放置10 min。此時(shí)溶液應(yīng)變清亮,簡短離心以去除管蓋內(nèi)壁的液滴,然后擠壓去除拭子,將盡可能多的裂解液轉(zhuǎn)移至新的離心管
中。
注意1:加入緩沖液GB時(shí)可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,一般70℃ 放置時(shí)會(huì)消失,不會(huì)影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如溶液未變清亮,說明細(xì)胞裂解不徹底,可能導(dǎo)致提取DNA量少和提取出的DNA
不純。
注意2:如果由于拭子上細(xì)胞數(shù)少導(dǎo)致提取的基因組DNA少于1 µg,可以在添加緩沖液GB的同時(shí)添加Carrier RNA(客戶自備,目錄號:RT416)。
4. 加200 μl無水乙醇,充分顛倒混勻,簡短離心以去除管蓋內(nèi)壁的液滴。
注意:加入無水乙醇后可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀,但不影響DNA提取。
5. 將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入一個(gè)吸附柱CR2中(吸附柱CR2放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g)離心30 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2放回收集管
中。
6. 向吸附柱CR2中加入500 μl緩沖液GD(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)離心30 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2放回收集管中。
7. 向吸附柱CR2中加入600 μl 漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)離心30 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2放回收集管。
8. 重復(fù)操作步驟7。
9. 12,000 rpm (~13,400×g)離心2 min,倒掉廢液。將吸附柱CR2室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。
注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的殘留會(huì)影響后續(xù)的酶反應(yīng)(酶切、PCR等)實(shí)驗(yàn)。
10. 將吸附柱CR2轉(zhuǎn)入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜中間位置懸空滴加20-50 μl 洗脫緩沖液TB,室溫放置2-5 min,12,000 rpm (~13,400×g)離心2 min。
注意:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于20 μl,體積過小影響回收效率。為增加基因組DNA的得率,可將離心得到的溶液再加入吸附柱CR2中,室溫放置2 min,12,000 rpm
(~13,400×g)離心2 min。洗脫液的pH對于洗脫效率有很大影響。若用ddH2O做洗脫液應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5范圍內(nèi),pH值低于7.0會(huì)降低洗脫效率;且DNA產(chǎn)物應(yīng)保存
在-20℃,以防DNA降解。
DNA濃度及純度檢測
得到的基因組DNA片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān);厥盏玫降腄NA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測濃度與純度。
DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰,OD260值為1相當(dāng)于大約50 μg/ml雙鏈DNA、40 μg/ml單鏈DNA。OD260/OD280比值應(yīng)為1.7-1.9,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,而使用ddH2O,比值會(huì)偏低,因?yàn)閜H值和離子存在會(huì)影響光吸收值,但并不表示純度低。
選配試劑 RNase A(100 mg/ml);Carrier RNA儲存條件 該試劑盒置于室溫(15-25℃)干燥條件下,可保存12個(gè)月,更長時(shí)間的保存可置于 2-8℃。2-8℃保存條件下,若溶液產(chǎn)生沉淀,使用前應(yīng)將試劑盒內(nèi)的溶液在室溫放置一段時(shí) 間,必要時(shí)可在37℃水浴中預(yù)熱10 min,以溶解沉淀。