禽流感病毒 H5 和 H7 亞型雙重實(shí)時熒光
RT-PCR 檢測試劑盒使用說明書
用途 本試劑盒采用實(shí)時熒光 RT-PCR 方法檢測禽組織、分泌物、排泄物及尿囊液中禽流感病毒 H5
(AIV-H5)和 H7 亞型(AIV-H7)的 RNA,適用于 AIV-H5、AIV-H7 的檢測、診斷和流行病學(xué)調(diào)查。 原理 利用離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜提取樣品總 RNA,在高效反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,以 RNA 為模板,以引 物為起點(diǎn)合成與 RNA 模板互補(bǔ)的 cDNA 鏈。在熱啟動 Taq 酶的作用下,經(jīng)高溫變性、中溫退火及 延伸的循環(huán),使特異 DNA 片段的拷貝數(shù)放大一倍,經(jīng)熒光素標(biāo)記的探針與擴(kuò)增的 DNA 雜交,利用 Taq 聚合酶的 5'→3'外切活性,使熒光探針的報告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,發(fā)出特異性熒光信號,利用 熒光 PCR 儀檢測特異性熒光信號,根據(jù)樣品 Ct 值的大小及擴(kuò)增曲線的形成情況判定結(jié)果。
試劑盒組成
名稱 | 50 頭份 | 貯藏條件 |
裂解液 | 30 mL |
室溫(A 盒) |
洗液 | 60 mL | |
洗脫液 | 10 mL | |
吸附柱和收集管 | 50 套 | |
陰性對照 | 1 mL |
-20 ℃(B 盒) |
陽性對照 | 600 µL | |
無菌無核酸酶水 | 600 µL | |
RT-PCR 反應(yīng)液 | 600 µL | |
酶混合液 | 25 µL | |
熒光探針 | 140 µL |
保存期本產(chǎn)品有效期為 12 個月。
需要自備的器材
1.儀器:分析天平、離心機(jī)、熒光 PCR 擴(kuò)增儀、組織研磨器、-20 ℃冰箱、可調(diào)移液器(2 µL、20
µL、200 µL、1000 µL)。
2.耗材:熒光 PCR 專用反應(yīng)管、眼科剪、眼科鑷、生理鹽水、1.5 mL 經(jīng)焦碳酸二乙酯(DEPC)水 處理的滅菌離心管、吸頭(10 µL、200 µL、1000 µL)、滅菌雙蒸水。
使用注意事項(xiàng)
1.所有接觸病料的物品均應(yīng)合理處置,以免污染實(shí)驗(yàn)室。
2.PCR 整個試驗(yàn)分配液區(qū)、模板提取區(qū)、擴(kuò)增區(qū)。流程順序?yàn)榕湟簠^(qū)→模板提取區(qū)→擴(kuò)增區(qū)。嚴(yán) 禁器材和試劑倒流。
3.所有試劑應(yīng)在規(guī)定的溫度儲存。-20℃保存的各試劑管使用前應(yīng)完全融化,8000 rpm 離心 15 s, 使液體全部沉于管底,放于冰盒中,吸取液體時移液器吸頭盡量在液體表面層吸取,使用后立 即放回-20 ℃。
4.在 RNA 提取過程中,避免 RNA 酶污染,盡量縮短操作時間。
5.注意防止試劑盒組分受污染。不要使用超過有效期限的試劑,試劑盒之間的成分不要混用。
6.嚴(yán)格遵守操作說明可以獲得最好的結(jié)果。操作過程中移液、定時等全部過程必須精確。
7.反應(yīng)體系應(yīng)在特定配液區(qū)或者超凈工作臺中配制,整個實(shí)驗(yàn)過程嚴(yán)格控制污染。
8.反復(fù)凍融試劑將降低檢測靈敏度,本試劑盒應(yīng)在 3 次內(nèi)用完,請嚴(yán)格按試劑盒說明書操作。
樣品制備
1 樣品采集:病死或撲殺禽,取喉氣管、腦、胸肌、心肌和肺等組織;待檢活禽,用棉拭子取呼吸 道分泌物或排泄物,置于 50%甘油生理鹽水中。2~8 ℃保存,送實(shí)驗(yàn)室檢測。(要求送檢病料新鮮, 嚴(yán)禁反復(fù)凍融。)
2 樣品處理:每份樣品分別處理。
2.1 組織樣品處理:每份組織分別從三個不同的位置稱取樣品約 1g,用手術(shù)剪剪碎混勻后取 0.02 g 于研磨器中研磨,加入 1.5 mL 生理鹽水繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5 mL 滅菌離心管中,8000 rpm 離心 2 min,取上清液 100 µL 于 1.5 mL 滅菌離心管中。
2.2 陽性對照處理:取陽性對照 100 µL,置 1.5 mL 滅菌離心管中。
2.3 陰性對照處理:取陰性對照 100 µL,置 1.5 mL 滅菌離心管中。
操作步驟
1 病毒 RNA 的提取
1.1 取已處理的樣品、陰性對照和陽性對照,分別加入裂解液 600 µL,充分顛倒混勻,室溫靜置 3~
5 min。
1.2 將液體吸入吸附柱中(吸附柱要套上收集管,吸取液體時盡量不要吸到懸浮雜質(zhì),以免離心時 堵塞吸附柱),13000 rpm 離心 30 s。
1.3 棄去收集管中液體,加入 600 µL 洗液,13000 rpm 離心 30 s。
1.4 重復(fù)步驟 1.3。
1.5 棄去收集管中液體,13000 rpm 空柱離心 2 min,以除去殘留的洗滌液。
1.6 將吸附柱移入新的 1.5 mL 離心管中,向柱中央加入洗脫液 50 µL,室溫靜置 1 min,13000 rpm
離心 30 s,離心管中液體即為模板 RNA。
2 實(shí)時熒光 RT-PCR 操作
設(shè)被檢樣品、陰性對照和陽性對照總和為 N,每份總體積 20µL,反應(yīng)體系配制如下:
試劑 | 體系 |
無菌無核酸酶水 | 2.3(N+1)µL |
RT-PCR 反應(yīng)液 | 10(N+1)µL |
酶混合液 | 0.4(N+1)µL |
熒光探針 | 2.3(N+1)µL |
將以上配制的反應(yīng)體系充分混勻后,分裝每個反應(yīng)管中各 15 µL。
分別取 5 µL 模板 RNA,加入相應(yīng)反應(yīng)管中,混勻并作好標(biāo)記,其中 AIV-H7 熒光報告基團(tuán)為 FAM,AIV-H5 為 HEX,淬滅基團(tuán)均為 None(如果儀器沒有 HEX 校正過,可暫時用 VIC 代替)。在 熒光 PCR 儀上進(jìn)行以下反應(yīng):45 ℃ 15 min,95 ℃ 1min;95 ℃ 5 s,60 ℃ 35 s,在每個循環(huán)第二步
(60℃ 35s)收集熒光信號,共 40 個循環(huán)。
結(jié)果判定
1 結(jié)果分析條件設(shè)定 閾值設(shè)定原則:閾值線設(shè)定于剛好超過陰性對照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn)。不同儀器可根據(jù)儀器噪音
情況進(jìn)行調(diào)整。
2 結(jié)果描述及判定
陽性對照 Ct 值≤30 并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,陰性對照無 Ct 值并且無特定擴(kuò)增曲線,實(shí)驗(yàn)結(jié) 果成立;被檢樣品若 FAM 熒光信號 Ct 值≤30 并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線為 H7 陽性;被檢樣品若 Hex 熒光信號 Ct 值≤30 并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線為 H5 陽性;被檢樣品 30<Ct<35 并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線, 需重新取樣提取 RNA,擴(kuò)增后進(jìn)行結(jié)果判定,如仍是可疑,可判定為陽性;被檢樣品 Ct 值≥35 時, 超過本方法檢測靈敏度范圍,判定為陰性;對于某些未呈現(xiàn) S 型曲線,但本底較高的樣品,應(yīng)為陰 性。