正式測(cè)定前務(wù)必取 2-3 個(gè)預(yù)期差異較大的樣本做預(yù)測(cè)定測(cè)定意義
測(cè)定原理
3-磷酸甘油酸激酶催化三磷酸甘油酸和 ATP 生成 1,3 二磷酸甘油酸。GAPDH 逆向催化 1,3 二磷酸甘油酸和 NADH 生成 3 磷酸甘油醛、無機(jī)磷和NAD,340nm 處測(cè)定 NADH 的減少量可反映GADPH 活性的高低。需自備的儀器和用品
分光光度計(jì)/酶標(biāo)儀、恒溫水浴鍋、臺(tái)式離心機(jī)、可調(diào)式移液器、微量石英比色皿/96 孔板、研缽、冰和蒸餾水。試劑的組成和配制
提取液一:液體 100mL×1 瓶,4℃保存。提取液二:液體 100mL×1 瓶,4℃保存。試劑一:粉劑×1 瓶,-20℃保存;試劑二:液體 20mL×1 瓶,4℃保存; 試劑三:液體 14uL×1 支,4℃保存; 組織樣本的前處理
①總 GAPDH 酶提。建議稱取約 0.1g 樣本,加入 1mL 提取液一,冰浴勻漿后超聲破碎(冰
浴,200W,破碎 3s,間歇 7s,總時(shí)間 1min),然后 4℃,8000g 離心 10min,取上清測(cè)定。
②胞漿和葉綠體 GAPDH 酶的分離:按照植物組織質(zhì)量(g):提取液體積(mL)為 1:5~10的比例(建議稱取約 0.1g 樣本,加入 1mL 提取液一),冰浴勻漿后于 4℃,200g 離心 5min,棄沉淀,取上清在 4℃,8000g 離心 10min,取上清用于測(cè)定胞漿 GAPDH 酶活性,取沉淀加 1mL 提取液二,震蕩溶解后超聲破碎(冰浴,200W,破碎 3s,間歇 7s,總時(shí)間 1min),然后 4℃,8000g 離心 10min,取上清測(cè)定葉綠體中 GAPDH 酶活性。
建議測(cè)定總 GAPDH 酶活性,按照步驟①提取粗酶液,若需要分別測(cè)定胞漿和葉綠體中的
GAPDH,則按照步驟②提取粗酶液。
細(xì)菌或培養(yǎng)細(xì)胞的前處理
先收集細(xì)菌或細(xì)胞到離心管內(nèi),離心后棄上清;按照細(xì)菌或細(xì)胞數(shù)量(104 個(gè)):提取液一體積(mL)為 500~1000:1 的比例(建議 500 萬細(xì)菌或細(xì)胞加入 1mL 提取液一),超聲波破碎細(xì)菌或細(xì)胞(冰浴,功率 20%或 200W,超聲 3s,間隔 10s,重復(fù) 30 次);8000g 4℃離心 10min,取上清,置冰上待測(cè)。
測(cè)定步驟
1、 分光光度計(jì)或酶標(biāo)儀預(yù)熱 30min 以上,調(diào)節(jié)波長至 340nm,蒸餾水調(diào)零。2、 樣本測(cè)定
- 工作液的配制:將試劑二全部倒入試劑一瓶中,充分溶解,37℃(哺乳動(dòng)物)或 25℃( 其它物種)預(yù)熱 10 分鐘;用不完的試劑分裝后-20℃保存,禁止反復(fù)凍融。
- 在試劑三中加入 500μL 蒸餾水,充分混勻待用;用不完的試劑分裝后-20℃保存,禁止反復(fù)凍融。
- 在微量石英比色皿或 96 孔板中加入 5μL 樣本、5μL 試劑三和 190μL 工作液,混勻,加入最后一個(gè)試劑的同時(shí)開始計(jì)時(shí),記錄 340nm 處20s 時(shí)的吸光值 A1 和 5min20s 后的吸光值 A2,計(jì)算 ΔA=A1-A2。
GAPDH 活性計(jì)算
- 用微量石英比色皿測(cè)定的計(jì)算公式如下
- 按樣本蛋白濃度計(jì)算
單位的定義:每 mg 組織蛋白每分鐘消耗 1 nmol 的 NADH 定義為一個(gè)酶活力單位。
GAPDH(nmol/min/mg prot)=[ΔA×V 反總÷(ε×d)×109]÷(V 樣×Cpr) ÷T=1286×ΔA÷Cpr
- 按樣本鮮重計(jì)算
單位的定義:每 g 組織每分鐘消耗 1 nmol 的 NADH 定義為一個(gè)酶活力單位。
GAPDH(nmol/min/g 鮮重)=[ΔA×V 反總÷(ε×d)×109]÷(W ×V 樣÷V 樣總) ÷T=1286×ΔA÷W
- 按細(xì)菌或細(xì)胞密度計(jì)算
單位的定義:每一萬個(gè)細(xì)菌或細(xì)胞每分鐘消耗 1 nmol 的 NADH 定義為一個(gè)酶活力單位。GAPDH(nmol/min/104 cell)=[ΔA×V 反總÷(ε×d)×109]÷(500 ×V 樣÷V 樣總) ÷T=2.572×ΔA V 反總:反應(yīng)體系總體積,2×10-4 L;ε:NADH 摩爾消光系數(shù),6.22×103 L / mol /cm;d: 比色皿光徑,1cm;V 樣:加入樣本體積,0.005 mL;V 樣總:加入提取液體積,1 mL;T: 反應(yīng)時(shí)間,5 min;Cpr:樣本蛋白質(zhì)濃度,mg/mL;W:樣本質(zhì)量,g;500:細(xì)菌或細(xì)胞總數(shù),500 萬。
- 用 96 孔板測(cè)定的計(jì)算公式如下
- 按樣本蛋白濃度計(jì)算
單位的定義:每 mg 組織蛋白每分鐘消耗 1 nmol 的 NADH 定義為一個(gè)酶活力單位。
GAPDH(nmol/min/mg prot)=[ΔA×V 反總÷(ε×d)×109]÷(V 樣×Cpr) ÷T=2572×ΔA÷Cpr
- 按樣本鮮重計(jì)算
單位的定義:每 g 組織每分鐘消耗 1 nmol 的 NADH 定義為一個(gè)酶活力單位。
GAPDH(nmol/min/g 鮮重)=[ΔA×V 反總÷(ε×d)×109]÷(W ×V 樣÷V 樣總) ÷T=2572×ΔA÷W
- 按細(xì)菌或細(xì)胞密度計(jì)算